Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  112  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32557655--32557704
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2.3
22
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6
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12
0
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2.4
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0
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1.92
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73
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20
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29
1.94
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161
2.8
159
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10
440
34
20
15
28
1.94
32558373--32558540
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2.0
85
88
6
252
37
17
16
29
1.91
32558458--32558669
74
2.9
72
84
9
282
31
21
16
30
1.96
32558458--32558672
75
2.9
74
85
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294
31
20
16
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1.95
32558674--32558708
14
2.5
14
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0
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60
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19
16
30
1.94
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4.6
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2
131
25
17
32
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1.97
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28
2.5
28
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126
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15
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1.96
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29
4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
32567847--32567918
28
2.5
28
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2
126
27
15
30
26
1.96
32571124--32571286
70
2.3
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303
19
27
17
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1.94
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29
5.5
29
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4
180
25
31
16
26
1.97
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5.5
29
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4
180
25
31
16
26
1.97
32582698--32582829
70
1.9
71
81
7
162
26
21
9
42
1.83
32584398--32584440
20
2.3
18
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0
18
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1.50
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0
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7
6.7
7
95
0
85
27
0
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2.3
18
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0
57
19
28
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45
1.76
32594314--32594358
21
2.1
21
95
4
81
35
44
15
4
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32594314--32594369
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2.6
21
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8
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46
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5
1.71
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9
3.6
9
91
8
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35
0
0
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126
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18
16
37
1.92
32597680--32598266
251
2.4
244
89
2
881
28
18
16
37
1.92
32598369--32598610
130
2.0
123
81
11
289
39
19
2
38
1.67
32598583--32598625
15
2.8
16
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3
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51
34
0
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1.42
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2.8
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98
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532
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17
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41
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17
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0
97
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0
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1.32
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21
2.7
21
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0
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25
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1.86
32607447--32607481
17
2.1
17
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37
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2
54
1.39
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18
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52
65
6
0
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1.17
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21
1.9
21
94
5
71
20
30
38
10
1.86
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48
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84
8
174
23
29
18
28
1.98
32615066--32615184
46
2.6
45
82
10
136
27
29
16
26
1.97
32624328--32624380
13
3.8
13
77
18
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32
28
26
13
1.93
32624313--32624386
30
2.5
30
95
0
130
28
24
29
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1.97
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17
3.6
17
75
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26
26
29
17
1.97
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2.3
68
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160
20
28
15
34
1.94
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24
2.0
26
84
15
68
34
18
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44
1.61
32649930--32649979
21
2.4
21
83
3
66
36
24
16
24
1.94
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2.0
21
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51
2
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5
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5
95
4
89
59
0
0
40
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32651151--32651209
26
2.4
25
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93
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0
0
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0.99
32651147--32651209
21
3.1
21
91
6
96
55
0
0
44
0.99
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20
1.9
20
94
0
67
31
23
13
31
1.93
32652502--32652600
39
2.5
40
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121
27
20
15
37
1.92
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19
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51
15
23
0
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1.35
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30.2
5
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3
32
1.19
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13.4
12
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1
3
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1.19
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32
72
22
89
63
0
3
33
1.13
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61
0
4
34
1.16
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1.12
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11
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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27
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24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
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27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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25
21
26
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438