Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1131211--1131277
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0
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0
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2
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0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
2
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2.2
22
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2
2
39
1.23
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28
2.1
29
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3
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2.9
17
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2
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37
0
1
60
1.08
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2.7
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39
0
0
60
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2.1
20
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29
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2.3
58
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178
33
11
30
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1.91
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2.3
55
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200
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29
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203
33
9
29
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1.88
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4.3
55
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10
224
27
26
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1.85
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2.3
63
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27
28
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2.1
137
96
0
529
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19
24
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4.2
26
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4
155
36
23
7
33
1.83
1219104--1219211
52
2.1
52
91
0
171
36
23
7
33
1.83
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15
4.0
15
72
21
51
67
7
7
16
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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1.01
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2.7
15
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13
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2.3
43
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27
23
26
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1.79
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23
21.4
23
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36
23
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33
1.79
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12
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22
22
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1.99
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1.9
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100
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25
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1.54
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38
38
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1.60
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18
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14
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14
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0
63
52
5
19
22
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1240466--1241123
89
7.4
88
85
5
776
35
18
16
28
1.93
1240372--1241217
270
3.2
263
81
8
894
36
18
16
28
1.93
1241060--1241286
76
3.1
75
90
5
354
32
21
16
29
1.96
1242797--1243109
49
6.4
49
96
0
545
28
8
33
29
1.87
1243210--1243331
37
3.3
37
97
0
226
25
19
33
21
1.97
1245400--1245851
29
15.6
29
98
0
805
26
19
31
22
1.98
1246335--1246433
41
2.4
41
80
11
114
26
24
24
25
2.00
1248479--1248791
49
6.4
49
98
0
581
27
8
33
30
1.87
1248892--1249013
37
3.3
37
97
0
226
25
19
33
21
1.97
1259805--1259838
17
2.1
17
94
5
61
2
44
0
52
1.16
1266670--1266745
40
1.9
40
91
0
125
25
30
11
32
1.91
1266710--1266830
47
2.6
47
77
13
133
23
28
19
28
1.98
1267464--1267510
19
2.5
19
80
16
53
40
0
2
57
1.11
1268368--1268496
3
42.0
3
75
16
74
60
3
1
34
1.24
1268481--1268564
34
2.5
34
98
0
159
54
3
10
30
1.52
1268549--1268601
18
2.9
18
78
10
72
60
3
11
24
1.47
1268456--1268678
12
18.6
12
67
18
99
56
2
10
30
1.45
1272186--1272231
20
2.3
20
81
3
58
26
17
28
28
1.98
1272260--1272372
28
3.9
28
69
18
88
26
20
26
26
1.99
1274244--1274353
37
2.8
37
75
6
94
20
20
27
31
1.97
1279983--1280055
36
2.0
36
97
0
137
20
6
19
53
1.67
1281186--1281223
18
2.0
20
85
10
53
10
10
0
78
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1282158--1282255
48
2.0
48
100
0
196
51
10
10
28
1.68
1288839--1288930
18
5.2
18
85
2
123
32
15
21
30
1.94
1288835--1288930
35
2.7
36
86
1
140
32
15
20
31
1.94
1299635--1299772
68
2.0
67
97
1
258
47
4
5
42
1.45
1300291--1300331
2
20.5
2
89
0
64
53
0
0
46
1.00
1303625--1303657
15
2.1
16
88
5
50
57
6
3
33
1.38
1305804--1305834
2
15.5
2
93
0
53
54
0
45
0
0.99
1322340--1322377
19
2.0
20
89
5
60
65
0
0
34
0.93
1322589--1322861
129
2.1
127
82
5
316
33
21
20
23
1.97
1326270--1326319
23
2.2
23
82
7
57
26
8
8
58
1.54
1329673--1329705
13
2.5
13
95
0
57
45
24
9
21
1.80
1334945--1335030
46
1.9
45
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4
120
31
29
18
20
1.97
1337388--1337567
75
2.4
75
84
3
220
32
21
18
27
1.97
1337388--1337786
40
10.6
40
71
14
244
32
21
18
27
1.97
1337423--1337682
115
2.3
115
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1
387
33
21
18
26
1.96
1337551--1337799
75
3.3
75
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3
322
34
21
17
26
1.95
1337390--1337821
190
2.3
185
85
2
560
33
21
18
26
1.97
1337393--1337828
35
11.7
35
72
13
196
33
22
18
26
1.96
1341630--1341751
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2.1
57
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6
165
47
6
18
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1.73
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2
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2
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0
50
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0
0
52
1.00
1357101--1357133
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2.4
14
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10
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78
0
18
3
0.87
1357900--1357927
6
4.7
6
100
0
56
53
0
17
28
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1357881--1357929
26
1.9
25
84
12
64
51
0
16
32
1.45
1358411--1358578
52
3.1
52
63
24
121
35
4
14
45
1.65
1358374--1358593
110
2.0
110
97
0
413
35
4
16
43
1.69
1369142--1369175
2
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2
100
0
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0
50
0
50
1.00
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100
0
50
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0
0
12
0.53
1372479--1372551
29
2.4
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8
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15
1
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1.55
1372766--1372815
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15
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1.30
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17
100
0
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14
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0
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7
1.14
1373024--1373065
19
2.2
20
86
4
59
4
11
7
76
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438