Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  119  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34858458--34858642
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
34858451--34858642
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23
28
23
24
2.00
34867203--34867486
49
5.9
49
93
3
479
33
8
28
29
1.86
34867203--34867486
144
2.0
145
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0
552
33
8
28
29
1.86
34867250--34867729
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5.0
94
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344
33
7
27
31
1.85
34867478--34867771
48
6.2
48
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1
520
32
6
28
32
1.83
34875532--34875669
40
3.5
40
83
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149
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28
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24
1.99
34875572--34875720
78
1.9
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1.99
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0
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1.9
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1.9
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228
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19
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2
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2.2
17
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0
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0
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1.14
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0
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1.21
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5
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5
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13
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38
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23
1.92
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90
3.4
90
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10
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1.70
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18
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14
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24
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0
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20
17
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24
8.6
24
96
0
342
20
17
25
36
1.95
34908029--34908160
47
2.8
48
84
1
176
34
28
15
20
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34911421--34911628
40
5.2
40
82
2
229
25
23
26
24
2.00
34919444--34919651
40
5.2
40
82
2
229
25
23
26
24
2.00
34922457--34922547
37
2.4
37
96
1
164
25
32
18
23
1.97
34922587--34922738
48
3.2
48
98
0
286
32
28
5
33
1.81
34922730--34923062
49
6.9
49
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3
550
28
27
9
33
1.88
34922730--34923064
145
2.3
143
93
1
580
28
27
9
33
1.88
34922730--34923064
96
3.5
95
94
2
557
28
27
9
33
1.88
34930909--34930985
27
2.8
28
90
3
113
37
16
16
28
1.91
34936390--34936513
63
2.0
63
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0
230
29
24
26
20
1.99
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15
2.0
15
93
0
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23
26
10
40
1.86
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215
2.0
215
99
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30
0
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21
2.4
21
80
0
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25
17
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25
2.2
25
81
6
60
26
10
23
39
1.87
34972149--34972202
21
2.5
22
81
3
65
14
31
33
20
1.93
34972933--34972957
12
2.1
12
100
0
50
32
8
8
52
1.60
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2.4
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5
142
30
16
23
30
1.96
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19
2.1
19
100
0
78
25
10
35
28
1.89
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20
3.6
20
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0
126
18
31
34
15
1.92
34994364--34994394
12
2.6
12
100
0
62
6
35
25
32
1.82
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2.0
44
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19
1.95
35000593--35000742
68
2.3
64
81
7
167
32
16
25
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35000735--35000880
49
2.9
51
84
2
197
26
20
26
27
1.99
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20
2.0
20
100
0
80
40
0
5
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1.22
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0
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1.00
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0
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1.11
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13
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62
48
1
0
50
1.11
35013162--35013221
22
2.6
23
87
10
79
48
1
0
50
1.11
35013281--35013317
19
1.9
19
88
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43
2
0
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1.14
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2.0
29
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1.11
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2.9
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29
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26
15
32
25
1.96
35024020--35024178
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2.8
57
80
3
176
26
15
32
25
1.96
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29
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15
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17
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72
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17
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1.19
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17.0
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23
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1.14
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1.10
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29
2.9
28
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71
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29
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0
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26
0
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1.56
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2.9
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30
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3
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.95
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27
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26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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202
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26
25
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438