Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   

This is table  207  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64086594--64086638
20
2.2
20
88
0
63
33
22
8
35
1.85
64091394--64091550
42
3.7
42
82
2
190
26
22
17
33
1.96
64092982--64093086
51
2.1
51
90
0
165
36
22
15
25
1.93
64096385--64096615
79
2.9
79
82
7
247
25
22
27
25
2.00
64096385--64096608
40
5.6
39
85
4
236
24
22
27
25
2.00
64096455--64096641
79
2.4
77
83
9
218
25
20
27
26
1.99
64102321--64102479
42
3.8
42
81
2
176
26
23
15
33
1.95
64104845--64104890
19
2.4
19
100
0
92
36
10
17
34
1.85
64107118--64107190
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
64108352--64108405
21
2.8
20
81
10
58
5
14
1
77
1.03
64114579--64114674
38
2.5
39
86
3
131
33
11
11
43
1.77
64114583--64114693
38
2.8
39
82
5
109
34
10
11
43
1.76
64119325--64119354
15
1.9
16
93
6
53
10
26
13
50
1.73
64121330--64121459
65
2.0
65
100
0
260
41
16
10
30
1.83
64122974--64123084
58
1.9
58
87
5
163
27
31
16
25
1.96
64122974--64123084
29
3.9
28
83
8
134
27
31
16
25
1.96
64128137--64128289
40
3.8
40
89
0
216
24
22
27
25
2.00
64128137--64128330
40
4.8
40
81
5
187
24
22
26
26
2.00
64128137--64128330
80
2.4
80
79
5
221
24
22
26
26
2.00
64130809--64130894
28
3.0
28
86
3
118
27
29
15
27
1.96
64131104--64131139
16
2.2
16
90
0
54
11
25
16
47
1.79
64131104--64131146
16
2.7
16
79
13
52
11
23
16
48
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64140539--64140724
40
4.7
40
86
5
227
25
22
26
25
2.00
64140539--64140757
80
2.8
80
79
12
238
26
22
26
24
2.00
64148555--64148740
40
4.7
40
86
5
227
25
22
26
25
2.00
64148555--64148773
80
2.8
80
79
12
238
26
22
26
24
2.00
64151316--64151349
17
1.9
18
88
5
52
50
5
5
38
1.51
64151942--64151979
17
2.2
17
90
0
58
42
2
0
55
1.14
64164560--64164656
50
1.9
50
97
0
185
38
9
19
32
1.84
64165518--64165571
27
2.0
27
100
0
108
48
3
18
29
1.65
64170110--64170170
23
2.7
22
77
10
61
19
22
18
39
1.92
64176299--64176354
27
2.2
25
75
12
58
41
14
16
28
1.87
64176308--64176361
27
2.0
28
88
3
83
42
11
14
31
1.81
64179523--64179658
42
3.2
43
82
6
145
32
26
11
29
1.92
64186936--64187163
40
5.7
40
89
3
343
25
25
22
25
2.00
64197767--64197876
6
17.8
6
71
15
73
50
14
15
20
1.79
64197767--64197876
31
3.5
31
89
0
166
50
14
15
20
1.79
64198284--64198508
27
8.3
27
81
7
226
25
19
17
37
1.93
64198285--64198506
54
4.1
53
82
3
255
25
19
17
37
1.93
64198283--64198498
81
2.7
81
90
2
319
25
19
17
37
1.93
64198542--64198993
27
16.7
27
85
0
548
30
8
21
38
1.84
64198599--64199000
108
3.7
108
92
0
624
31
8
20
38
1.83
64199894--64200341
224
2.0
223
95
1
808
42
18
10
28
1.83
64200328--64200373
23
2.0
23
95
0
83
15
17
19
47
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64204309--64204386
40
2.0
40
84
5
104
30
23
17
28
1.97
64204320--64204626
114
2.7
114
82
2
350
33
20
17
28
1.96
64204669--64204718
21
2.3
21
82
3
64
16
2
28
54
1.53
64205183--64205211
13
2.1
14
93
6
51
13
0
41
44
1.44
64205329--64205375
14
3.4
14
84
0
67
12
0
34
53
1.39
64207935--64207960
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
64210130--64210375
85
2.9
85
82
8
304
23
16
29
30
1.96
64210130--64210375
42
5.8
42
82
3
280
23
16
29
30
1.96
64210346--64210405
30
2.0
30
86
0
84
23
11
30
35
1.90
64210463--64210510
25
1.9
25
100
0
96
12
16
31
39
1.86
64214393--64214462
37
1.9
35
83
11
88
41
1
2
54
1.24
64214393--64214502
19
5.9
18
67
19
57
40
1
3
53
1.29
64223905--64224086
49
3.7
49
83
2
256
28
25
19
25
1.99
64223909--64224091
100
1.8
100
96
0
339
28
25
20
25
1.99
64226793--64226817
13
1.9
13
100
0
50
8
32
32
28
1.86
64228912--64228958
18
2.5
19
82
6
60
76
2
4
17
1.04
64228914--64228958
6
7.3
6
80
5
54
77
2
4
15
1.02
64231139--64231372
55
4.4
54
75
10
198
22
25
17
35
1.95
64238249--64238345
48
2.0
48
82
6
115
20
17
31
29
1.96
64241692--64241767
38
2.0
38
100
0
152
34
26
15
23
1.95
64244368--64244525
48
3.3
47
77
5
174
27
26
17
29
1.97
64246131--64246160
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64246686--64246754
20
3.5
19
84
9
86
43
23
24
8
1.82
64247091--64247121
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
64253829--64254107
145
1.9
145
98
0
540
30
24
13
31
1.94
64255690--64255730
21
2.0
21
90
0
64
24
7
41
26
1.81
64259017--64259048
17
1.9
17
93
6
57
34
6
21
37
1.79
64262662--64262793
67
2.0
65
88
2
192
44
16
6
31
1.74
64265016--64265064
9
5.3
9
86
13
73
0
14
0
85
0.59
64265016--64265059
17
2.5
18
92
3
72
0
13
0
86
0.57
64268536--64268753
29
7.5
29
88
3
296
26
30
16
27
1.96
64270041--64270084
17
2.5
17
81
3
52
9
13
0
77
0.99
64271537--64271652
58
2.0
58
93
0
196
32
10
15
41
1.81
64273215--64273396
46
4.0
46
90
1
258
21
23
14
40
1.91
64275531--64275582
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
64278421--64278602
46
4.0
46
90
1
258
21
23
14
40
1.91
64280733--64280784
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
64282300--64282341
22
1.9
22
90
0
66
28
19
33
19
1.96
64282550--64282589
21
1.9
21
89
0
62
47
20
7
25
1.75
64286357--64286410
18
3.1
18
86
2
74
35
27
22
14
1.93
64286400--64286442
17
2.5
18
82
17
56
34
37
16
11
1.85
64288062--64288285
39
5.7
40
86
5
262
25
27
21
24
1.99
64288064--64288285
79
2.8
79
83
6
279
25
27
22
24
2.00
64297580--64297608
14
2.1
14
100
0
58
34
0
20
44
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64300680--64300917
38
6.3
38
90
0
341
31
24
22
21
1.98
64304160--64304195
3
12.0
3
100
0
72
66
33
0
0
0.92
64304194--64304261
3
22.7
3
96
0
127
66
0
1
32
1.01
64304886--64304928
20
2.2
20
86
0
59
0
25
0
74
0.82
64305178--64305259
32
2.6
30
84
11
94
48
6
2
42
1.41
64312475--64312516
17
2.4
18
84
11
61
26
35
19
19
1.95
64317961--64318010
21
2.4
21
93
0
82
10
18
14
58
1.63
64323546--64323575
4
7.5
4
100
0
60
23
0
76
0
0.78
64328417--64328466
25
2.0
25
100
0
100
36
4
8
52
1.50
64329673--64329720
19
2.5
19
86
6
62
50
0
25
25
1.50
64331012--64331147
23
5.8
24
73
9
84
26
21
16
35
1.95
64331060--64331153
45
2.1
45
82
7
111
24
21
15
38
1.92
64335563--64335769
24
8.6
24
96
0
342
36
25
17
20
1.95
64337801--64337973
46
3.7
46
77
10
190
22
20
27
30
1.98
64337798--64337968
93
1.8
93
91
0
279
22
20
28
29
1.98
64350068--64350218
40
3.8
40
75
15
134
27
23
26
23
2.00
64350104--64350234
40
3.3
40
79
6
158
25
22
27
24
2.00
64358077--64358227
40
3.8
40
75
15
134
27
23
26
23
2.00
64358113--64358243
40
3.3
40
79
6
158
25
22
27
24
2.00
64360954--64361134
48
3.8
48
75
5
159
24
29
19
26
1.99
64366603--64366799
55
3.6
54
79
2
216
18
23
18
39
1.92
64366596--64366799
53
3.8
53
79
1
210
18
23
18
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64367794--64367831
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
64369468--64369557
27
3.3
27
87
6
128
44
23
10
22
1.82
64380480--64380537
28
2.0
29
86
3
82
17
41
22
18
1.90
64381489--64381751
47
5.6
45
81
7
233
23
28
19
28
1.98
64381489--64381754
94
2.8
92
79
14
278
24
28
19
27
1.98
64381489--64381754
140
1.9
141
85
5
369
24
28
19
27
1.98
64390596--64390724
40
3.3
39
76
5
134
24
27
24
24
2.00
64390612--64390761
40
3.8
39
78
9
126
22
26
24
26
2.00
64390612--64390760
80
1.9
79
83
6
194
21
26
24
26
1.99
64391402--64391429
12
2.3
12
100
0
56
21
14
21
42
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438