Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  294  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92127545--92127864
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48
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0
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2.3
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0
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14.7
27
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374
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19
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1.81
92145326--92145720
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7.3
54
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426
40
19
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31
1.81
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2.9
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20
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30
1.83
92148934--92149168
81
2.9
80
85
2
299
40
20
8
30
1.83
92149131--92149184
27
2.0
26
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3
81
40
20
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45
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2.2
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0
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0
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5
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19
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9
57
66
8
0
26
1.19
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18
2.2
18
86
0
53
70
2
2
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1.13
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4
22.2
4
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1
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1.03
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24
2.7
24
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4
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1
18
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6
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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15
0
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1.34
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17
5.4
17
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19
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45
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1.72
92191950--92192063
34
3.4
34
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210
43
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10
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1.78
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17
5.2
17
71
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10
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0
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4
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0
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2.0
18
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2.5
15
91
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2
23
1.32
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28
2.4
27
80
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68
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3
27
1.13
92205170--92205250
3
27.0
3
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29
2.0
29
87
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84
62
0
10
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17
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19
73
15
61
64
0
10
25
1.25
92205360--92205429
29
2.5
27
80
13
79
62
0
10
27
1.26
92205373--92205436
15
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11
58
65
0
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25
1.22
92206231--92206264
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41
0
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50
1.34
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12.6
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24
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92218124--92218202
41
1.9
42
82
7
99
27
12
2
56
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92218431--92218537
36
2.9
36
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20
2
11
1.37
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36
3.4
35
82
15
124
65
21
3
10
1.37
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15
2.0
15
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51
70
0
30
0
0.88
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14
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0
0
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0.98
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54
54
0
0
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0.99
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2.4
19
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56
55
0
0
44
0.99
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2.0
29
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87
44
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12
39
1.60
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27
22
27
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1.99
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2.2
20
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16
6
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16
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2
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1.20
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15
80
63
2
2
31
1.20
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2
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25
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33
0
0
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1.07
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3.7
27
78
18
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0
0
63
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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92244487--92244528
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19
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8
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2
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1.44
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40
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1.94
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27
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92405565--92405748
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2.00
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1.99
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0
0
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2.00
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2.6
22
72
5
53
41
19
25
14
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          433   434   435   436   437   438