Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6044382--6044438
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1.30
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22
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10
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198
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10
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1.78
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2.9
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0
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0
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83
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0
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1.96
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27
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119
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0
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2.5
237
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1036
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18
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4.2
83
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0
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20
20
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4.0
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2
212
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10
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1.80
6053640--6053772
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7.5
18
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13
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11
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12
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0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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35
0
0
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0.94
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3.0
27
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1
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7
0
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6055828--6055908
26
3.0
26
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7
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3
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18
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11
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6
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2.4
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6
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1.44
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4
75
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2
6
30
1.31
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2.3
27
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3
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0
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31
0
0
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2
131
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11
17
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2.1
28
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435
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10
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23
2.0
23
95
0
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25
2.1
25
92
0
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43
3
11
41
1.58
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3.4
147
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7
631
35
5
29
29
1.81
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29
2.0
29
100
0
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3
10
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141
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35
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28
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2.3
13
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0
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90
0
10
0
0.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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2
0
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1.9
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7
45
1.61
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3
88.3
3
67
16
99
60
2
9
27
1.42
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2.5
24
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1.21
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20
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1.95
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7.9
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26
19
19
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22
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1
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0
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20
20
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6104574--6104678
20
5.5
18
89
6
129
37
12
14
36
1.84
6104574--6104678
38
2.7
39
83
11
128
37
12
14
36
1.84
6105157--6105222
16
3.9
16
79
20
73
36
1
0
62
1.05
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26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
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7
5.6
7
100
0
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0
0
41
0.98
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3
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100
0
58
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0
0
34
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2.0
26
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10
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53
3
13
28
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6123456--6123500
3
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4
72
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2
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6123650--6123704
3
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3
100
0
110
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0
0
67
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6125175--6125204
2
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2
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0
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50
3
0
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0
0
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0
7
17
1.05
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5
100
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0
58
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0
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0
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26
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0
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0
0
0
100
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6145587--6145730
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20
21
28
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6145632--6145742
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42
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0
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0
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22
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2
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0
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29
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32
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14
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0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6175612--6175739
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4.9
26
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2
159
28
3
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1.39
6175612--6175772
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3.1
52
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6
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2.0
22
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1.9
19
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45
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25
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6178147--6178504
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2.3
155
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24
24
18
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438