Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  167  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51192329--51192456
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2.4
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24
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25
2.00
51192329--51192456
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170
27
24
22
25
2.00
51192601--51192692
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2.2
42
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0
130
28
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1.94
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1.97
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4.8
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13
193
26
19
30
23
1.98
51194523--51194752
97
2.5
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239
26
19
30
23
1.98
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40
5.2
40
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267
24
21
27
26
1.99
51198510--51198721
80
2.7
80
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24
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1.99
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2.0
30
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0
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22
26
24
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4.2
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169
26
22
26
24
2.00
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2.3
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20
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22
2.1
22
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2
50
1.38
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2.1
54
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22
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2.6
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10
60
17
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1.92
51239265--51239351
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2
122
40
10
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1.84
51239401--51239562
26
6.3
26
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2
197
29
17
24
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51239695--51239786
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2.2
42
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0
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1.92
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31
3.5
31
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0
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28
16
26
29
1.97
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27
2.4
27
80
14
80
26
23
9
41
1.84
51242127--51242261
27
4.9
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12
121
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16
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10
17
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1.84
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26
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26
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22
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25
26
1.97
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4.9
27
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10
128
41
16
7
34
1.76
51246894--51246960
20
3.3
20
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4
100
40
10
17
31
1.84
51247010--51247171
26
6.3
26
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2
224
28
21
22
27
1.99
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31
3.5
31
92
0
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17
25
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1.97
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27
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27
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5.2
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90
41
20
7
30
1.81
51249705--51249825
27
4.6
24
74
13
73
47
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27
1.75
51250714--51250780
20
3.3
20
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4
100
40
10
17
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1.84
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26
6.3
26
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242
28
19
23
27
1.99
51251114--51251205
42
2.2
42
88
0
130
31
14
20
33
1.92
51252983--51253232
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
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40
6.2
40
89
2
378
25
24
28
21
1.99
51261158--51261408
121
2.1
120
89
2
378
25
24
28
21
1.99
51262774--51262883
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3.5
31
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0
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28
18
27
26
1.98
51267408--51267511
28
3.7
28
75
8
86
29
29
13
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51269563--51269587
11
2.3
11
100
0
50
8
28
0
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1.22
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25
2.0
25
87
0
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36
8
14
40
1.75
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10
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10
100
0
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10
7
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1.31
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24
2.0
24
100
0
98
44
0
8
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2.2
23
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10
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38
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16
40
1.73
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1.9
23
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22
20
22
34
1.97
51273556--51273624
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22
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77
20
23
15
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2.0
55
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1.95
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4.8
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220
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31
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1.98
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1.9
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18
31
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1.97
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4.8
48
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11
213
25
18
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23
1.98
51280490--51280718
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19
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23
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1
140
25
17
32
25
1.97
51314270--51314341
36
2.0
36
94
0
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63
6
9
19
1.47
51319669--51319706
18
2.1
18
85
9
51
36
5
0
57
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
25
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0
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39
4
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2.0
13
100
0
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38
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7
30
1.83
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1.9
16
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0
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3
0
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1.16
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2.5
27
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42
2
1
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1.24
51328494--51328519
13
2.0
13
100
0
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7
15
30
1.74
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27
17.6
27
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4
403
40
20
8
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1.81
51348428--51348902
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5.9
81
81
2
533
40
20
8
31
1.81
51348428--51348921
54
9.2
55
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4
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19
8
31
1.81
51348545--51348957
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1.82
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27
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1
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23
1.95
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1.94
51348945--51349187
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321
36
18
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24
1.95
51349604--51349744
6
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6
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13
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21
16
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1.75
51349607--51349701
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1.79
51349604--51349769
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15
11
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1.75
51349657--51349732
37
2.1
37
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0
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22
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1.72
51351730--51352042
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11.6
27
89
0
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40
21
8
30
1.82
51351730--51352114
27
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27
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2
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39
20
9
30
1.84
51351730--51352114
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7.1
54
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2
434
39
20
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30
1.84
51352141--51352379
27
8.9
27
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3
286
35
17
21
25
1.95
51352142--51352378
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2
289
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17
21
24
1.95
51352143--51352384
107
2.2
108
88
0
360
35
18
21
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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19
17
14
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19
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18
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103
18
18
15
47
1.83
51352801--51352883
25
3.3
25
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0
130
19
18
14
48
1.81
51352888--51352952
25
2.6
25
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0
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1.84
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2.6
62
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1
247
18
18
14
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1.81
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2.3
20
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0
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31
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1.94
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33
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0
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1.98
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2.0
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1.98
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26
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21
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1.98
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1.95
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2
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1.95
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1
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3.0
19
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1
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1.28
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2
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1.03
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2.2
29
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2.5
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28
14
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1.95
51388736--51388817
27
3.0
27
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8
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29
15
24
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1.96
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28
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1.95
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1.9
18
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1.51
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1.33
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5.8
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86
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332
22
27
19
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51406120--51406404
98
2.9
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22
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1.98
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40
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21
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25
1.99
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21
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1.99
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1.99
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28
22
23
1.99
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1.99
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25
21
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26
1.99
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1.56
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142
2.1
141
78
7
299
45
2
11
40
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438