Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   

This is table  227  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69937827--69937970
46
3.1
44
76
15
141
29
28
20
22
1.98
69940332--69940419
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
69940332--69940410
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
69940343--69940419
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
69943371--69943541
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
69943363--69943538
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
69949997--69950078
39
2.1
38
95
2
146
43
9
8
37
1.68
69949998--69950061
20
3.2
20
67
20
62
43
9
7
39
1.66
69950733--69950766
8
4.2
8
92
0
59
35
2
23
38
1.70
69953295--69953319
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
69956483--69956616
26
5.2
26
98
0
259
35
26
6
30
1.82
69957195--69957289
17
5.4
17
70
18
61
64
0
7
28
1.20
69962892--69963020
46
2.8
46
91
0
213
29
27
21
21
1.99
69962897--69963039
46
3.1
44
74
13
119
28
27
21
22
1.99
69966893--69967054
5
32.6
5
93
3
283
59
19
0
20
1.42
69970357--69970503
40
3.7
40
89
0
204
31
20
22
25
1.98
69970601--69970683
40
2.1
40
88
0
121
28
18
22
30
1.97
69970989--69971169
7
25.4
7
67
9
53
23
1
29
45
1.60
69971002--69971169
14
11.3
14
67
12
66
23
1
30
45
1.61
69971059--69971111
22
2.5
21
84
3
70
24
0
28
47
1.52
69971064--69971098
15
2.4
14
86
9
52
22
0
31
45
1.53
69971059--69971122
21
3.0
21
83
2
74
21
0
32
45
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69976504--69976689
43
4.4
43
77
4
173
23
15
27
33
1.94
69977597--69977653
24
2.4
24
75
13
64
42
5
14
38
1.68
69977602--69977647
24
1.9
24
86
8
67
41
6
17
34
1.75
69978929--69978990
28
2.3
27
78
15
65
33
4
1
59
1.28
69979300--69979340
22
1.9
22
85
5
57
36
4
2
56
1.34
69980558--69981222
332
2.0
332
98
0
1296
28
15
24
30
1.96
69996123--69996164
3
14.0
3
100
0
84
33
0
0
66
0.92
70010323--70010438
6
19.2
6
94
5
207
33
0
16
50
1.46
70020551--70020603
24
2.2
24
93
3
90
33
15
0
50
1.44
70021237--70021265
14
2.0
15
93
6
51
31
0
0
68
0.89
70023119--70023245
62
2.0
62
92
0
209
28
33
18
19
1.95
70023414--70023465
22
2.4
22
100
0
104
26
32
32
7
1.85
70024959--70025043
44
1.9
44
90
0
134
30
25
18
24
1.98
70044381--70044410
8
3.9
8
95
4
53
10
40
0
50
1.36
70049124--70049153
15
2.0
15
100
0
60
20
33
20
26
1.97
70049398--70049481
44
1.9
44
87
0
123
34
26
17
21
1.96
70052912--70052992
36
2.2
38
76
14
89
59
2
7
30
1.38
70053010--70053055
24
1.9
24
86
0
65
54
0
6
39
1.26
70053080--70053140
30
2.0
30
84
6
79
62
3
1
32
1.21
70053096--70053131
16
2.2
16
95
0
63
66
0
2
30
1.06
70054245--70054270
13
2.0
13
100
0
52
23
30
30
15
1.95
70054844--70055474
205
3.1
205
87
2
847
27
21
18
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70055461--70055553
44
2.1
44
91
0
150
24
26
16
32
1.96
70055484--70055853
44
8.4
44
72
10
213
28
24
17
30
1.97
70055528--70055853
177
1.8
176
86
1
474
28
24
16
30
1.97
70055541--70055848
88
3.5
87
75
9
275
27
24
16
31
1.97
70068577--70068765
40
4.8
39
86
3
227
24
29
22
23
1.99
70071192--70071252
30
2.0
30
84
6
79
62
3
1
32
1.21
70071208--70071243
16
2.2
16
95
0
63
66
0
2
30
1.06
70071334--70071386
24
2.2
24
83
6
72
45
0
5
49
1.26
70071352--70071396
24
2.0
24
83
12
60
37
0
4
57
1.19
70072355--70072380
13
2.0
13
100
0
52
23
30
30
15
1.95
70075223--70075259
15
2.7
13
84
15
56
27
32
27
13
1.94
70075227--70075261
15
2.3
15
100
0
70
28
37
22
11
1.89
70078103--70078130
13
2.2
13
100
0
56
21
14
0
64
1.29
70084550--70084589
21
1.9
21
89
0
62
25
15
25
35
1.94
70092590--70092671
40
2.0
40
80
2
92
36
29
17
17
1.92
70092670--70092908
39
6.1
39
92
0
379
28
27
22
21
1.99
70100145--70100207
26
2.4
27
76
10
69
34
6
6
52
1.52
70100337--70100390
24
2.3
24
77
3
65
38
0
1
59
1.08
70100481--70100516
11
3.3
11
100
0
72
66
0
0
33
0.92
70100481--70100527
22
2.1
22
84
0
58
68
0
2
29
1.02
70100960--70101002
17
2.5
17
88
3
59
44
0
0
55
0.99
70100810--70101283
257
1.8
257
82
6
611
39
9
6
44
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70101293--70101326
17
2.1
16
88
5
50
35
5
0
58
1.22
70101473--70101566
41
2.2
42
81
9
120
37
1
5
56
1.29
70103203--70103240
5
7.6
5
93
0
67
18
2
0
78
0.86
70109996--70110070
36
2.1
36
97
0
141
37
20
10
32
1.87
70113994--70114055
32
1.9
32
100
0
124
40
16
22
20
1.91
70116265--70116298
13
2.6
13
95
0
59
23
20
32
23
1.98
70121730--70121903
46
3.8
46
79
10
192
22
21
27
28
1.99
70121726--70121897
93
1.8
93
91
0
281
22
21
28
27
1.99
70124865--70124914
15
3.4
15
86
2
66
10
18
12
60
1.59
70128395--70128474
37
2.2
37
100
0
160
32
27
12
27
1.93
70128653--70128795
39
3.7
39
89
2
225
23
29
20
26
1.99
70130513--70130688
46
3.8
46
77
4
183
22
21
27
28
1.99
70130509--70130680
93
1.8
93
89
0
272
22
21
27
27
1.99
70132351--70132389
12
3.5
11
86
6
53
61
7
2
28
1.37
70137325--70137382
27
2.2
26
81
3
71
31
3
1
63
1.21
70137363--70137427
30
2.2
31
89
10
100
40
3
7
49
1.47
70137438--70137498
10
6.3
9
76
12
59
27
4
3
63
1.30
70138029--70138056
13
2.2
13
100
0
56
28
0
0
71
0.86
70138766--70138850
39
2.2
39
97
0
161
51
5
10
31
1.60
70138930--70139073
72
2.0
72
98
0
279
38
6
20
34
1.79
70140662--70140691
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
70141520--70141553
16
2.1
17
88
5
52
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70145027--70145061
17
2.1
17
94
0
61
31
37
11
20
1.88
70147604--70147744
25
5.6
25
92
0
210
31
16
30
21
1.95
70154509--70154557
3
16.3
3
80
16
57
36
0
0
63
0.95
70154501--70154557
16
3.5
16
79
9
62
40
0
0
59
0.97
70160830--70160866
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
70163906--70163959
24
2.2
24
96
0
99
25
12
12
48
1.78
70179795--70180069
146
1.9
140
82
7
338
28
17
30
24
1.97
70188157--70188265
56
1.9
56
90
0
173
28
15
25
30
1.96
70195459--70195492
13
2.6
13
100
0
68
29
32
32
5
1.81
70196454--70196978
48
10.9
49
77
5
536
27
27
16
28
1.97
70196454--70196978
96
5.5
96
88
2
698
27
27
16
28
1.97
70196454--70196978
144
3.7
143
82
2
613
27
27
16
28
1.97
70207733--70207762
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
70218030--70218082
24
2.2
24
96
0
97
39
3
16
39
1.67
70220505--70220671
40
4.2
40
79
2
158
23
26
23
26
2.00
70234514--70234590
31
2.5
31
97
0
145
22
23
20
33
1.97
70234783--70234971
24
8.0
24
91
4
287
28
21
22
28
1.99
70234804--70234970
23
7.1
23
94
2
271
28
20
22
28
1.98
70234783--70234970
94
2.0
95
91
3
308
28
21
22
28
1.99
70234804--70234971
47
3.6
47
91
3
284
28
20
22
29
1.98
70235029--70235085
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
70235017--70235087
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70235022--70235076
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
70245597--70245647
25
2.0
25
96
0
93
49
9
15
25
1.75
70248028--70248060
16
2.1
16
100
0
66
12
12
18
57
1.64
70248943--70249090
73
2.0
73
94
0
260
31
15
25
28
1.96
70252964--70253161
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
70253030--70253147
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
70252998--70253161
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
70260544--70260741
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
70260610--70260727
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
70260578--70260741
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438