Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  34  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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25
43
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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11
50
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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29
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8351774--8351900
23
5.4
23
79
12
93
26
21
18
33
1.96
8355873--8355918
23
2.0
23
95
0
83
15
17
13
54
1.71
8359331--8359467
58
2.3
58
85
7
170
40
2
4
52
1.33
8359316--8359475
59
2.7
59
84
7
189
40
1
5
52
1.34
8359577--8359672
44
2.1
46
84
7
126
38
25
3
33
1.71
8359654--8359718
16
4.1
16
79
0
67
30
26
3
40
1.71
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27
19.6
27
88
0
732
33
19
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24
1.97
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27
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27
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20
22
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27
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18
17
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1.92
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2.3
31
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9
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18
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16
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2.8
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0
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2.2
24
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2.1
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0
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17
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1.83
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37
2.3
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37
1.84
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3
20.3
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100
0
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0
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2.5
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2.00
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1.9
18
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5
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5
100
0
66
0
21
0
78
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8452671--8452726
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2.2
24
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7
0
42
1.30
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21
2.0
21
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35
1.69
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43
8
7
39
1.64
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75
2.4
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8
208
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23
11
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1.89
8464431--8464597
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183
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8478573--8478604
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2.1
15
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0
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1.74
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19
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8478867--8478964
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0.81
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1.99
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23
22
23
1.99
8485728--8486202
250
1.9
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30
23
22
23
1.99
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207
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1.99
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19
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1.80
8486947--8487044
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35
1.80
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1.9
17
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1.63
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2.7
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53
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18
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2.8
19
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5
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7
11
50
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8494525--8494632
18
5.9
18
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4
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9
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1.79
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39
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0
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1.74
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2.0
19
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0
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8507115--8507254
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2.3
30
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84
47
5
19
27
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438