Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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23
2.00
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3.8
38
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0
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24
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23
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1.99
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39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
30212402--30212552
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
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27
2.5
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26
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119
25
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22
23
1.99
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137
25
28
22
23
2.00
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2.5
28
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2
133
28
12
27
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1.93
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2.0
45
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26
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4.2
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185
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27
21
25
1.99
30267926--30268092
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
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2.5
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53
34
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17
23
1.96
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1.91
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4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30279246--30279317
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2.5
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15
30
26
1.96
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29
4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
30286978--30287049
28
2.5
28
95
2
126
27
15
30
26
1.96
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2.3
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0
50
1.00
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2.9
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30
1.79
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27
10.9
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1.84
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1.84
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2.3
27
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35
2.0
35
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0
93
26
24
13
36
1.92
30342522--30342581
24
2.6
24
80
15
72
56
5
1
36
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30348135--30348241
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2.4
44
93
0
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26
16
28
1.97
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2
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2
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7
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50
1
3
44
1.30
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26
100
0
110
50
3
7
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1.48
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20
2.0
20
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6
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20
1.33
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4.3
43
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23
14
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1.95
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25
2.0
25
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1.63
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2.0
32
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1.63
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2.0
80
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22
22
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22
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57
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1.68
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2.8
12
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14
22
0
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1.31
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24
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1.96
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54
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24
18
1.96
30389466--30389630
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2.0
81
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4
262
34
23
24
18
1.96
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25
2.7
22
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22
20
25
1.98
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1
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22
24
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1.99
30400420--30400602
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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22
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34
23
17
23
1.96
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4.2
40
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2
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25
27
21
25
1.99
30411754--30411920
80
2.1
79
83
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205
25
27
21
25
1.99
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17
2.5
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22
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17
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1.96
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1.98
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2.0
44
95
0
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13
9
45
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30507645--30507693
17
3.0
17
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2
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1.33
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2.1
35
100
0
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10
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1.79
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30
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279
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0
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1.12
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38
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0
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30
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0
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26
21
25
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438