Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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24
24
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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19
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18
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4.2
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92
2
184
33
5
24
35
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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2.1
136
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18
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2.6
22
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26
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1.99
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29
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0
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123
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3
5
37
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7572261--7572300
16
2.5
16
92
8
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0
2
40
1.12
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5
6.2
5
92
0
53
83
0
16
0
0.64
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77
4.0
76
79
3
300
33
19
15
31
1.93
7574609--7574860
87
2.9
86
81
8
231
36
19
16
27
1.93
7574612--7574879
88
3.0
86
78
9
238
38
18
16
26
1.92
7575778--7575868
47
1.9
47
88
0
137
15
24
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48
1.79
7576562--7576614
13
4.0
13
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4
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15
54
11
18
1.70
7577516--7577692
3
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3
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2
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7577958--7578006
26
2.0
24
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8
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63
6
0
30
1.19
7577977--7578035
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21
78
12
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8
0
22
1.15
7578387--7578448
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30
0
8
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1.25
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27
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8
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30
8
8
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1.61
7578694--7578757
27
2.2
30
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6
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1.51
7578694--7578753
26
2.3
26
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8
77
33
6
6
53
1.53
7579000--7579034
2
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2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
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25
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13
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34
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7
50
1.57
7579047--7579212
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75
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1
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35
7
7
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1.58
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0
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0
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0
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26
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30
1.49
7590232--7590277
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7590239--7590283
23
2.0
23
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8
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40
13
8
37
1.76
7593224--7593263
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2.4
17
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0
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60
5
2
32
1.32
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3.7
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0
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0
8
43
1.33
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3.0
13
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7
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55
0
2
42
1.13
7597297--7597347
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14
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1
3
41
1.31
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1.9
126
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1
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0
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1.52
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2.2
29
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22
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12
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2.0
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0
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1.96
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2.2
34
83
7
89
24
4
6
64
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7645439--7645479
20
2.0
21
85
4
57
36
0
2
60
1.10
7645438--7645479
22
2.0
21
85
4
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38
0
2
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1.10
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2.0
42
100
0
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2
23
42
1.67
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0
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1.52
7668963--7669022
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2.3
26
82
8
77
33
6
6
53
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438