Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  370  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115237683--115237823
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5.2
27
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173
18
24
22
34
1.96
115237680--115237823
54
2.7
54
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2
236
18
24
22
34
1.96
115237695--115237841
27
5.5
26
82
8
116
21
25
19
34
1.96
115237683--115237841
81
2.0
79
81
10
189
20
24
20
34
1.96
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3.0
430
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1797
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14
15
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53
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0
0
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432
3.4
430
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4
1873
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14
14
35
1.87
115246553--115248040
431
3.4
431
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1893
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14
14
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2.1
28
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11
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20
7
0
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1.10
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2.1
29
88
8
90
36
22
0
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16
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14
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10
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69
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115264690--115264740
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3.2
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3
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1.18
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17
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1.43
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14
2.6
14
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4
65
33
13
5
47
1.67
115277683--115277917
75
2.8
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82
11
269
30
17
20
31
1.96
115277849--115277977
61
2.1
62
92
2
217
36
15
20
27
1.93
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138
2.8
137
83
7
424
31
16
21
29
1.96
115277909--115278176
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3.5
75
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351
31
16
21
30
1.95
115278241--115278511
77
3.5
77
79
10
252
32
14
18
34
1.91
115278723--115278795
28
2.5
28
78
10
76
38
19
2
39
1.66
115279819--115279878
25
2.4
26
81
15
74
35
5
5
55
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115279928--115280020
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3.0
30
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33
3
5
58
1.37
115284283--115284316
18
1.9
18
88
5
52
55
2
2
38
1.30
115284615--115284689
23
3.1
24
74
12
64
52
1
2
44
1.23
115284626--115284700
36
2.1
36
82
5
89
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0
1
49
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25
1.18
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21
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13
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67
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8
23
1.18
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2.0
29
83
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0
0
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0
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29
28
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115312986--115313157
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1.8
93
96
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29
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1.98
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91
29
0
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58
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71
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0
0
33
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66
0
0
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2
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2
100
0
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0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115330471--115330661
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100
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20
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1.98
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4.4
177
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27
22
19
30
1.98
115331032--115331128
44
2.2
45
80
10
110
27
26
19
25
1.99
115330571--115331394
353
2.3
353
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1068
27
22
19
30
1.98
115331550--115331804
64
4.0
64
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0
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17
30
1.89
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51
5
5
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74
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243
24
32
18
24
1.97
115358411--115358652
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5.1
47
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1
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29
12
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1.93
115358551--115358627
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3.4
22
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22
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28
28
12
29
1.94
115358486--115358672
94
2.0
90
82
8
225
30
26
11
31
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
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0
0
48
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0
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2
0
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3
0
33
1.12
115378919--115379024
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17
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1
0
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1.04
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2.0
20
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24
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1.96
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0
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35
1.85
115416544--115416658
18
5.8
22
86
10
96
35
9
17
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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25
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25
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2.0
327
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0
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0
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23
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28
20
22
28
1.99
115463301--115463468
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47
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284
27
20
22
28
1.99
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5.4
11
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16
55
30
20
12
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.81
115464883--115465143
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3.2
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23
29
1.81
115464881--115465143
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1.81
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0
0
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0
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3.9
7
100
0
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14
14
25
44
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438