Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  316  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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139
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23
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34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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(0-2)
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75
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25
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
132
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22
24
21
1.99
99139934--99140084
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99139930--99140101
40
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10
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21
26
23
1.99
99142529--99142704
48
3.7
48
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3
228
27
17
27
27
1.97
99142529--99142704
96
1.8
96
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2
255
27
17
27
27
1.97
99142529--99142736
96
2.2
96
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3
240
27
17
26
27
1.98
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18
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27
1.98
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19
2.1
19
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0
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0
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60
0
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23
2.1
23
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0
10
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99151886--99151935
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4.5
11
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14
66
54
0
22
24
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99151886--99151937
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17
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0
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23
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0
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106
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0
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2.7
24
85
4
76
35
3
12
48
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99192375--99192446
24
3.0
24
83
4
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2
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4.1
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0
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1.28
99202963--99203016
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0
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1.31
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2.3
44
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109
27
15
25
33
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438