Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  321  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100452998--100453102
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15
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71
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0
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21
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2.0
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0
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1.98
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2.0
66
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1.99
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106
1.9
105
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1
346
27
28
21
23
1.99
100455516--100455651
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3.4
40
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229
28
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100461757--100461810
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0
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1
11
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93
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28
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21
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28
21
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1.98
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20
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28
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28
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
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0
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0
0
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3
161
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19
29
23
1.98
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2.0
239
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29
17
26
25
1.97
100517302--100517532
48
4.8
48
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266
26
19
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25
1.98
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2.9
151
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3
554
30
24
17
27
1.97
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1.9
101
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1.98
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180
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1.97
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29
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116
20
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50
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2
347
30
24
17
28
1.97
100533021--100533465
151
2.9
151
85
3
554
30
24
17
27
1.97
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1.9
101
85
0
261
30
24
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1.98
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2.5
29
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26
31
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10
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1.9
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264
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24
14
28
1.94
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27
4.2
26
85
8
136
16
23
23
37
1.94
100542038--100542150
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2.1
54
86
5
156
16
23
23
37
1.94
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227
26
26
21
25
1.99
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55
2.4
55
91
1
205
27
13
24
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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77
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0
1
25
0.92
100589894--100589966
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3.3
22
79
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87
73
0
1
24
0.90
100589892--100589966
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2.5
27
83
14
78
74
0
1
24
0.89
100589893--100589965
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16.8
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77
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51
73
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24
0.90
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58
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0
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4.9
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18
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1.98
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0
132
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9
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24
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2.5
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8
130
24
24
28
22
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2.0
33
97
0
125
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10
22
20
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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23
1.99
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1.93
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26
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22
1.99
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0
39
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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29
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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172
27
21
24
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438