Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  194  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60281938--60281970
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0
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0
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1.59
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25
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2.2
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23
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21
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64
36
19
9
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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19
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1.84
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84
9.3
84
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3
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24
21
23
30
1.99
60346555--60347331
334
2.3
331
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3
1184
24
21
23
30
1.99
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1.9
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1.96
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23
30
16
30
1.96
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17
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1.96
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2.3
23
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5
0
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1.24
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29
2.6
29
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0
139
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14
31
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1.95
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28
2.6
28
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87
22
20
36
21
1.96
60391607--60391738
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2.3
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131
25
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33
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1.96
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2.6
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27
1.95
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29
2.6
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22
21
35
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1.96
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2.5
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1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
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225
28
28
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21
1.98
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206
4.5
206
92
2
1454
30
18
22
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60407840--60408769
413
2.3
413
91
2
1492
30
18
22
28
1.97
60410422--60410507
23
3.5
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1
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1.25
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0
0
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2.0
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2
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2.5
28
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133
28
12
27
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1.93
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1.15
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32
1.17
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1.10
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34
1.17
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64
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1.14
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23
17
29
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0
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3.0
30
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8
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10
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.64
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3.0
30
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8
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1.66
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46
3.8
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21
29
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1.98
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0
1
31
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
60536662--60536884
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1.9
119
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32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438