Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86370008--86370111
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1.9
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129
27
14
22
35
1.94
86387586--86387738
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27
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86401731--86401898
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1.99
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25
2.00
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124
1.8
124
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1
326
30
10
24
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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21
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0
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86462881--86463060
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25
2.00
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26
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28
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1.97
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0
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1.82
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0
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1.98
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2.1
27
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0
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26
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28
1.97
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2.0
75
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2.3
20
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20
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1.91
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5.5
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28
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22
1.99
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288
25
28
23
22
1.99
86505047--86505243
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4.1
49
89
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292
27
30
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1.87
86505062--86505243
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28
29
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32
1.88
86513407--86513457
24
2.1
24
100
0
102
37
13
3
45
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86521983--86522035
23
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15
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49
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18
25
29
1.98
86524134--86524326
100
1.9
100
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298
26
18
25
30
1.98
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43
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29
26
15
30
1.95
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25
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1.95
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1.96
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178
25
21
26
26
1.99
86575064--86575116
26
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25
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3
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16
22
1.94
86575767--86575799
14
2.4
14
100
0
66
36
15
6
42
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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8
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21
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10
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15
0
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1.18
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1.93
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46
2.6
47
84
5
147
26
22
14
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1.93
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45
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0
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28
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21
1.99
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10
10
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86613246--86613376
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25
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10
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1.65
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17
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1.69
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1.98
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1.95
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0
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1.93
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22
1.99
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26
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2.00
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2.1
15
100
0
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1.97
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2.0
55
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0
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27
28
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1.99
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40
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27
21
22
1.99
86662459--86662612
79
2.0
78
93
3
265
27
27
21
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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0
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22
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1.99
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22
22
1.99
86699541--86699760
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28
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22
22
1.99
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1.95
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1.94
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1.96
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1.97
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1.99
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29
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1.98
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29
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3.0
30
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1.62
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5.2
15
78
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79
56
15
16
11
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86731527--86731698
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1.8
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0
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30
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20
1.98
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3.8
46
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28
29
21
20
1.98
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2.0
30
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0
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1.84
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29
19
28
22
1.98
86737554--86737775
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2.4
93
86
3
293
29
19
28
22
1.98
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4.1
8
92
0
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0
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3.6
47
73
15
154
28
18
29
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438