Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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476
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17
28
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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25
1.98
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1.9
263
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19
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2
202
29
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135
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38
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2
112
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21
23
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
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0
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7
14
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5297276--5297488
106
2.0
106
83
3
268
38
14
16
30
1.89
5301120--5301187
3
22.7
3
96
0
127
66
0
1
32
1.01
5301889--5301948
31
1.9
32
93
3
104
40
21
6
31
1.79
5302744--5302806
31
2.0
31
100
0
126
19
19
17
44
1.87
5302867--5302972
2
53.0
2
96
0
194
0
0
48
51
1.00
5306235--5306394
24
6.7
24
65
13
71
35
17
24
23
1.96
5308882--5308953
23
3.1
23
80
4
65
70
4
22
2
1.17
5315295--5315578
135
2.1
134
81
4
338
12
16
27
44
1.83
5315295--5315594
90
3.3
90
84
0
377
13
16
27
43
1.85
5315295--5315601
45
6.8
45
79
5
298
13
16
27
42
1.85
5319373--5319402
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
5319369--5319402
12
2.8
12
95
0
59
44
0
5
50
1.26
5321830--5321875
24
2.0
22
83
8
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32
2
4
60
1.28
5322028--5322054
14
1.9
14
100
0
54
37
0
0
62
0.95
5327180--5327237
3
19.3
3
96
0
89
65
5
0
29
1.14
5335741--5335779
11
3.4
11
89
10
60
35
0
0
64
0.94
5335737--5335792
23
2.3
24
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12
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42
0
0
57
0.99
5339721--5339761
12
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12
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0
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19
2
14
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1.41
5352350--5352555
88
2.3
88
92
0
331
28
19
22
29
1.98
5352348--5352607
44
5.9
44
72
7
159
28
18
23
28
1.98
5352521--5352785
137
1.9
137
85
0
368
31
17
22
28
1.97
5360642--5360683
20
2.0
20
86
9
57
30
0
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5366755--5366788
11
3.1
11
86
0
50
8
0
2
88
0.62
5371017--5371073
27
2.1
27
83
6
71
45
7
0
47
1.30
5374537--5374573
2
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2
100
0
74
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0
0
51
1.00
5379356--5379403
2
24.5
2
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4
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50
0
0
50
1.00
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2.0
30
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0
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9
24
1.70
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17
2.1
18
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5
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0
0
16
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40
2.0
40
97
0
149
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5
13
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3
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100
0
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0
0
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2
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0
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0
0
50
1.00
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2.1
17
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54
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20
1.68
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22
2.1
22
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44
4
31
19
1.70
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237
1.8
235
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2
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0
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0
0
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100
0
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0
0
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2.0
20
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14
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1.87
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19
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2
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1.23
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78
2.0
79
98
1
307
57
7
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1.51
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2.2
16
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0
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1.77
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14
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14
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1
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1
23
1.62
5428805--5428876
21
3.5
20
71
21
58
36
43
0
20
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5428848--5428909
32
1.9
32
83
0
79
43
37
0
19
1.51
5429427--5429686
41
6.4
41
86
3
337
22
23
21
32
1.98
5429440--5429686
122
2.0
123
85
5
331
22
23
21
32
1.98
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0
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0
0
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0
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18
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15
0
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42
1.47
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36
17
16
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1.92
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1.93
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156
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20
14
27
1.92
5437971--5438305
84
3.9
86
82
8
398
36
21
14
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438