Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  425  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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0
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2.0
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100
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2.8
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2.3
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0
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.3
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2.0
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34
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2.3
21
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22
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0
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10
16
36
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23
23
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29
1.98
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29
19
22
27
1.98
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3.6
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21
16
33
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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14
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1.80
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2.0
23
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2.5
41
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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17
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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184
36
24
4
33
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438