Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   

This is table  3  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
759718--759903
46
4.0
46
90
1
257
22
22
14
40
1.90
762040--762091
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
763205--763280
32
2.6
28
73
16
73
44
5
6
43
1.52
763222--763284
32
2.0
32
87
0
90
41
4
7
46
1.54
766053--767098
510
2.0
511
95
0
1896
26
25
18
29
1.98
770423--770465
15
2.9
15
79
3
52
53
2
9
34
1.46
773632--773686
24
2.3
24
87
0
83
45
1
1
50
1.22
781214--781273
30
2.0
30
96
0
111
33
31
13
21
1.92
786664--786695
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
803646--803679
15
2.3
15
100
0
68
64
0
5
29
1.17
803734--803829
44
2.2
44
78
12
99
28
5
5
61
1.39
810802--810847
21
2.2
21
92
3
76
47
10
19
21
1.80
814321--814402
30
2.7
30
81
10
96
28
8
30
32
1.87
818449--818494
15
3.1
15
90
9
76
21
52
8
17
1.71
818817--818845
15
2.0
15
93
6
51
13
0
10
75
1.04
833217--833246
14
2.1
15
93
6
53
0
53
0
46
1.00
833204--833256
22
2.4
22
78
12
63
0
54
0
45
0.99
833727--833776
17
2.9
18
77
14
52
36
0
2
62
1.07
833809--833839
13
2.3
14
94
5
55
38
0
9
51
1.35
842322--842381
15
4.1
15
86
2
86
18
55
8
18
1.67
842428--842479
25
2.1
25
100
0
104
42
3
3
50
1.39
847390--847429
21
1.9
21
100
0
80
32
17
10
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
850168--850202
17
2.0
18
88
5
54
74
2
8
14
1.17
850781--850855
3
25.0
3
100
0
150
33
0
0
66
0.92
851310--851356
24
1.9
24
83
12
60
34
0
6
59
1.23
851400--851438
21
1.9
20
89
5
60
23
2
10
64
1.37
851636--851700
31
2.1
31
100
0
130
35
9
6
49
1.60
855503--855548
21
2.2
21
96
0
83
34
17
8
39
1.80
862117--862154
3
12.7
3
100
0
76
31
0
0
68
0.90
865910--865976
29
2.3
30
80
12
79
44
4
10
40
1.59
867598--867625
3
9.3
3
100
0
56
64
0
0
35
0.94
869664--869698
17
2.1
17
94
0
61
54
8
0
37
1.31
871600--871631
6
5.3
6
92
0
55
28
37
18
15
1.92
871969--872009
21
2.0
21
85
9
57
51
0
0
48
1.00
875042--875106
17
3.5
18
77
12
60
60
4
0
35
1.18
878291--878330
22
1.9
20
85
10
53
15
12
12
60
1.60
889465--889503
5
7.6
5
94
2
51
43
2
0
53
1.14
889486--889531
18
2.6
19
73
13
53
36
4
0
58
1.18
889507--889561
23
2.4
23
84
6
76
45
3
0
50
1.19
890490--890546
30
1.9
29
82
10
71
49
1
3
45
1.29
892506--892923
213
2.0
213
82
3
520
33
10
21
35
1.87
908870--908896
3
9.0
3
100
0
54
66
0
33
0
0.92
914189--914220
6
5.2
6
92
7
55
65
0
0
34
0.93
914191--914219
13
2.2
13
100
0
58
72
0
0
27
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
922038--922064
12
2.2
12
100
0
54
48
0
0
51
1.00
922460--922497
16
2.4
16
86
0
58
28
2
0
68
1.03
928374--928424
19
2.7
18
76
8
57
25
5
5
62
1.41
928848--928878
2
15.5
2
100
0
62
51
48
0
0
1.00
930842--930889
24
2.0
25
92
8
82
29
29
14
27
1.95
935458--935489
6
5.3
6
100
0
64
50
18
0
31
1.48
945248--945302
19
2.9
19
81
10
60
63
0
1
34
1.05
945253--945380
47
2.8
46
75
10
118
60
1
3
34
1.22
954750--954777
13
2.2
13
100
0
56
57
21
7
14
1.61
955032--955095
23
2.9
22
75
15
60
39
0
1
59
1.07
955048--955089
22
1.9
22
85
9
59
42
0
0
57
0.99
955406--955442
19
1.9
19
88
0
56
59
0
2
37
1.12
955454--955514
24
2.5
25
76
10
63
63
0
3
32
1.10
959538--959584
2
23.5
2
95
0
85
51
2
0
46
1.13
966339--966378
2
20.5
2
94
5
73
50
0
0
50
1.00
969004--969036
16
2.1
16
100
0
66
30
0
18
51
1.46
972977--973043
29
2.3
29
89
0
107
47
8
10
32
1.69
976317--976439
61
2.0
62
98
1
239
24
34
6
34
1.81
977399--977664
46
6.0
46
86
7
343
21
23
15
39
1.92
977577--977652
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
979800--979851
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
981887--981990
28
3.7
27
75
10
86
23
26
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
981895--982109
56
3.8
56
87
0
286
25
29
17
28
1.97
981915--982107
28
6.9
28
74
6
158
25
29
16
29
1.97
982068--982152
43
2.0
43
92
0
143
25
29
16
28
1.97
984393--984487
41
2.3
40
80
5
100
65
6
2
26
1.28
984928--984996
29
2.3
31
83
14
83
57
2
4
34
1.33
985408--985476
20
3.4
19
73
15
57
44
0
2
52
1.16
987740--987788
23
2.1
23
96
0
89
30
2
30
36
1.69
990117--990157
20
2.0
20
100
0
82
46
14
14
24
1.82
996963--996997
5
7.0
5
93
0
52
22
2
20
54
1.58
1000948--1000983
5
7.0
5
93
6
63
19
0
2
77
0.88
1001544--1001613
15
4.7
15
72
13
56
28
7
0
64
1.20
1001542--1001660
44
2.7
45
79
18
112
28
6
0
64
1.18
1001571--1001623
15
3.3
15
85
12
70
26
5
0
67
1.12
1003139--1003281
9
15.7
9
63
13
51
60
0
3
34
1.19
1003936--1003967
17
1.9
16
93
6
55
56
6
0
37
1.25
1004400--1004430
15
2.1
15
100
0
62
12
35
12
38
1.82
1011789--1011840
21
2.5
21
84
3
70
26
19
1
51
1.57
1013151--1013197
24
2.0
24
86
0
67
55
0
0
44
0.99
1019043--1019081
18
2.2
18
95
0
69
20
20
2
56
1.54
1021281--1021346
33
2.0
33
93
0
114
31
7
13
46
1.71
1021487--1021511
9
2.8
9
100
0
50
24
44
0
32
1.54
1022572--1022639
9
7.6
9
83
0
82
47
17
8
26
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1022659--1022698
6
6.5
6
88
5
62
17
0
2
80
0.83
1022880--1022904
6
4.2
6
100
0
50
0
16
0
84
0.63
1027578--1027625
24
2.0
24
84
8
62
58
4
2
35
1.29
1027812--1027863
9
5.7
9
84
4
68
67
1
0
30
1.02
1027812--1027864
19
2.8
19
82
2
72
67
1
0
30
1.01
1027859--1027908
24
2.1
23
81
3
55
68
4
4
24
1.24
1033558--1033608
22
2.4
22
80
3
59
47
0
7
45
1.32
1041720--1041766
5
9.0
5
80
17
51
8
14
0
76
1.01
1041721--1041775
27
2.0
27
100
0
110
14
10
0
74
1.07
1042235--1042275
21
2.0
20
90
4
64
24
0
0
75
0.80
1042238--1042301
9
7.6
8
75
16
51
23
1
3
71
1.08
1042260--1042302
10
4.4
9
82
11
50
20
2
4
72
1.14
1050467--1050502
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
1055286--1055327
2
21.0
2
95
0
75
50
0
2
47
1.14
1057972--1058025
20
2.6
20
82
5
63
64
3
1
29
1.21
1063670--1063721
21
2.5
21
82
14
63
53
7
1
36
1.41
1065363--1065425
30
2.1
31
85
11
87
41
0
0
58
0.98
1065336--1065427
29
3.4
28
73
25
81
40
1
0
58
1.05
1067880--1068631
299
2.5
293
82
7
852
28
9
21
40
1.84
1072465--1072489
11
2.3
11
100
0
50
48
20
0
32
1.50
1083370--1083400
16
2.0
15
93
6
53
32
6
0
61
1.21
1093416--1093457
14
3.1
14
79
6
50
52
2
2
42
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1094566--1094600
17
2.0
18
88
5
54
88
0
8
2
0.61
1096445--1096470
13
2.0
13
100
0
52
53
7
7
30
1.57
1104926--1104992
31
2.2
31
86
0
89
44
19
8
26
1.80
1105225--1105407
59
3.1
59
78
4
183
39
8
13
38
1.74
1112298--1112334
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
1114078--1114129
21
2.5
21
80
0
59
55
3
3
36
1.36
1115745--1116251
60
8.6
59
77
10
425
23
19
17
39
1.92
1119172--1119208
17
2.2
17
100
0
74
5
5
16
72
1.21
1119307--1119357
25
2.0
25
96
0
93
47
11
21
19
1.81
1127451--1127489
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438