Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  406  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126276233--126276308
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37
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0
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5
27
0
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1.26
126293746--126293835
3
29.7
3
82
10
103
32
5
1
61
1.26
126295515--126295594
6
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0
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80
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1
77
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2.0
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0
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1.17
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31
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42
1.70
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25
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2
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23
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2.3
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26
2.0
26
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63
37
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2
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4.3
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1.78
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3.8
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17
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0
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1.03
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13
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12
54
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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2.5
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33
1.56
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18
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1
0
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8
115
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0
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2.0
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2
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3.4
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1
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30
21
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1.96
126395018--126395128
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2.6
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25
1.96
126395466--126395599
66
2.0
66
85
5
182
12
27
16
43
1.84
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2.1
13
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5
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29
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2.2
22
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20
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32
42
1.71
126411335--126411542
68
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48
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15
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1.65
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2.6
11
100
0
58
37
17
10
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126422124--126422165
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19
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80
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0
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1.00
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1.40
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Percent
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Period
Size
Copy
Number
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27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438