Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  24  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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25
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0
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31
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
2.1
29
96
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38
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1.82
6273848--6273910
29
2.3
27
91
8
101
39
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0
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2.1
17
88
5
52
26
0
2
70
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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25
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20
74
25
27
21
26
1.99
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2.2
60
83
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157
25
25
20
28
1.99
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6315896--6315949
20
2.9
19
84
10
67
68
1
0
29
1.00
6315938--6315980
16
2.8
15
82
13
52
79
0
0
20
0.74
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13
1.9
13
100
0
50
24
40
20
16
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2.4
22
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0
95
48
25
7
19
1.75
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18
2.0
19
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58
45
29
0
24
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39
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38
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14
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4
2
40
1.33
6330382--6330507
68
1.9
67
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3
41
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6330383--6330524
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0
17
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2.0
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35
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38
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0
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6351126--6351189
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1.29
6351126--6351189
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2.6
24
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29
62
31
9
0
59
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6351256--6351308
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28
0
5
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1.15
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10
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0
5
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2.8
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2.0
20
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0
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27
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23
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6391315--6391429
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54
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23
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2.0
43
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131
21
19
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6395232--6395398
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1.9
90
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0
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0
0
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28
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1.83
6403426--6403900
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23
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6
219
29
22
20
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438