Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1999825--1999982
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3.7
43
96
0
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22
35
19
22
1.96
2000278--2000405
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2.1
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1.39
2007334--2007394
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2.3
27
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0
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26
22
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1.99
2008275--2008393
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2.0
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186
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12
1
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1.49
2012737--2012838
37
2.6
38
75
20
95
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4
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1.41
2013540--2013565
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2.2
12
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0
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46
0
46
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1.31
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5
0
11
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0.83
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11
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4
4
8
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5
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1.13
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30
2.1
30
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41
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9
19
1.83
2014377--2014765
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4.5
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14
242
35
19
16
28
1.94
2014731--2015486
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9.4
78
69
16
266
32
19
17
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243
4.1
245
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5
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19
17
28
1.94
2014934--2015486
78
7.0
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15
355
32
19
17
29
1.95
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92
2.1
90
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6
236
34
19
20
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2015028--2015486
157
2.8
167
80
10
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31
20
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500
2.4
491
80
8
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34
19
17
28
1.94
2015180--2015486
75
4.0
75
83
7
366
31
20
17
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1.96
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54
1.9
54
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9
144
37
19
15
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1.92
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222
1.9
211
85
6
552
37
20
15
26
1.93
2015551--2015716
72
2.3
71
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4
244
41
21
15
22
1.89
2015751--2015973
70
3.1
70
83
5
306
38
22
14
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2015554--2016140
257
2.3
258
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1
1072
36
22
14
25
1.93
2015716--2015973
70
3.7
69
82
7
294
36
22
14
25
1.92
2026926--2026951
12
2.2
12
100
0
52
46
0
46
7
1.31
2026989--2027080
34
2.7
35
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5
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2026980--2027060
31
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9
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12
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0
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1
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7
83
0.86
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61
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2.0
20
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21
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2044320--2044370
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2.0
131
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18
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0
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2.0
21
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64
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10
5
57
1.52
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2.0
23
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27
0
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2.0
52
100
0
210
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88
2.0
88
97
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5
18
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1.72
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60
2.3
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7
144
37
5
14
42
1.70
2071813--2071852
18
2.3
18
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12
57
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2
0
30
1.04
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10
50
30
2
0
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20
2.0
20
85
0
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25
12
12
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2
21.5
2
100
0
86
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2099223--2099268
24
2.0
23
83
12
58
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6
6
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1.55
2099998--2100030
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2.1
16
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2
100
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0
0
50
1.00
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2.0
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34
9
9
45
1.70
2102964--2103024
29
2.1
29
81
6
70
36
11
11
40
1.77
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2.1
30
90
0
99
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1.9
30
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0
87
33
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1.94
2104733--2104798
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2.2
29
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7
78
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1.93
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1.9
24
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0
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50
8
4
36
1.53
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32
2.1
32
97
0
123
48
13
4
33
1.63
2105882--2105919
18
2.2
17
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13
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2
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1.00
2107684--2107718
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2.3
15
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5
0
31
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1.18
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150
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28
9
19
1.84
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13
2.6
13
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5
14
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1.67
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1.94
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1.94
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20
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4
356
37
22
14
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2109700--2109963
71
3.7
69
84
4
339
37
22
14
25
1.92
2109539--2110130
257
2.3
256
94
2
1031
36
22
14
25
1.93
2115154--2115189
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
2117747--2117781
15
2.3
15
95
0
61
5
0
31
62
1.18
2117777--2117810
12
2.9
11
91
8
50
0
8
2
88
0.62
2120957--2121004
6
8.3
6
79
9
55
41
2
0
56
1.11
2122336--2122376
22
1.9
21
85
14
57
26
0
2
70
0.99
2122602--2122644
22
2.0
22
90
0
68
55
4
13
25
1.58
2126363--2126408
22
2.1
22
95
0
83
19
28
13
39
1.89
2131063--2131340
144
1.9
144
82
2
344
24
20
23
30
1.98
2145528--2145566
18
2.2
18
95
0
69
53
5
35
5
1.45
2145546--2145643
44
2.2
44
89
5
144
48
9
27
14
1.73
2146242--2146332
48
1.9
48
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6
114
38
2
3
56
1.28
2153401--2153571
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
2153393--2153573
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
2156761--2156819
20
2.8
22
75
12
70
13
27
22
37
1.91
2159546--2159655
48
2.3
48
77
11
127
39
2
0
58
1.13
2170745--2170774
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
2174911--2174957
2
23.5
2
100
0
94
48
0
0
51
1.00
2176681--2176710
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
2178210--2178266
21
2.5
22
83
10
71
35
1
3
59
1.25
2178231--2178295
31
2.2
28
84
10
85
33
3
4
58
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2178340--2178416
25
3.2
25
67
20
65
31
6
6
55
1.51
2180427--2180488
35
1.9
30
81
18
72
51
12
14
20
1.75
2191703--2191745
22
2.0
22
81
9
52
32
4
11
51
1.59
2191991--2192017
5
5.4
5
100
0
54
81
0
0
18
0.69
2199706--2199754
19
2.6
20
81
9
59
28
20
4
46
1.68
2206394--2206463
31
2.3
31
94
0
122
48
12
12
25
1.77
2207329--2207428
39
2.6
39
95
0
173
42
4
2
52
1.31
2207422--2207455
17
2.0
17
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0
50
50
0
2
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1.16
2208290--2208349
11
5.2
11
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52
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1
0
35
1.05
2209258--2209286
12
2.3
13
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5
51
44
0
0
55
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12
3.4
12
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15
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61
2
0
35
1.09
2214589--2214613
12
2.1
12
100
0
50
36
0
0
64
0.94
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20
2.6
19
90
6
73
34
0
6
59
1.22
2217602--2217651
26
1.9
26
84
8
66
62
4
2
32
1.25
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15
2.5
15
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8
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23
0
2
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0.95
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21
1.9
20
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60
35
10
23
30
1.88
2224178--2224207
15
1.9
16
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6
53
20
0
6
73
1.05
2224218--2224275
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3.1
19
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14
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0
0
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2.3
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0
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0
0
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10
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9
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67
4
2
25
1.20
2235188--2235213
4
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4
100
0
52
50
23
0
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1.50
2238197--2238222
12
2.2
12
100
0
52
34
15
30
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2238494--2238541
17
2.8
17
70
0
51
31
4
0
64
1.12
2238550--2238595
24
2.0
24
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4
76
45
0
0
54
0.99
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24
1.9
24
86
0
65
67
6
6
19
1.36
2248168--2248202
18
1.9
18
88
0
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57
2
2
37
1.29
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2.0
26
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0
0
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0.99
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1
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1
100
0
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0
0
0
100
0.00
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2.0
29
100
0
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3
37
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2.1
16
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5
50
33
0
3
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1.10
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2
100
0
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0
0
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2285346--2285389
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2.6
16
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10
52
38
0
0
61
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438