Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  1  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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25
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0
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2.0
21
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2
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0
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0
0
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1.9
120
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302
24
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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29
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90
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16
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1.96
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143398--143647
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71
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266
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21
15
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2.2
12
100
0
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23
15
7
53
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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197531--197573
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0
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32
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
265342--265384
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10
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2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
270726--270784
27
2.2
27
87
0
82
20
23
32
23
1.98
275260--275305
21
2.2
21
100
0
92
10
4
13
71
1.27
279335--279367
15
2.1
16
88
5
50
18
0
15
66
1.25
280546--280585
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
281698--281724
14
1.9
14
100
0
54
40
0
0
59
0.98
290550--290624
31
2.5
29
75
14
71
30
2
18
48
1.62
297519--297543
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
311700--311731
2
16.0
2
93
0
55
53
0
0
46
1.00
311709--311861
39
3.8
39
70
20
93
60
5
2
30
1.34
312088--312173
3
28.3
3
73
19
65
65
1
3
30
1.17
312088--312170
12
6.8
12
76
16
73
65
1
3
30
1.17
312093--312173
18
4.4
18
79
13
76
65
1
3
29
1.17
312088--312174
27
3.4
27
71
19
78
65
1
3
29
1.16
312472--312520
25
2.0
25
88
8
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53
24
2
20
1.56
312630--312686
21
2.7
21
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2
96
17
10
50
21
1.75
313050--313778
44
16.6
44
75
8
590
26
23
18
31
1.97
313093--313690
132
4.5
132
94
1
1004
26
23
18
31
1.98
313890--314088
68
2.9
68
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3
260
28
20
22
29
1.98
314164--314830
43
15.3
44
68
11
338
20
22
22
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
20.6
43
70
13
430
20
23
21
34
1.96
314106--315016
132
7.0
132
76
10
612
20
23
21
34
1.96
314106--315005
85
10.3
85
73
13
502
20
23
21
34
1.96
314239--315018
217
3.6
217
96
1
1411
20
23
21
34
1.96
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1.9
66
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0
227
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19
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1.90
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8.0
6
95
0
87
2
31
16
50
1.57
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12
3.5
12
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3
50
58
4
0
37
1.19
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3
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71
18
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1
4
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1.22
320547--320626
12
6.8
12
72
12
67
63
1
5
30
1.23
320543--320608
36
2.0
32
83
16
82
60
1
4
33
1.26
320963--321023
23
2.8
20
75
20
61
54
32
1
11
1.46
321090--321146
21
2.7
21
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2
96
17
10
50
21
1.75
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3
8.7
3
100
0
52
34
30
0
34
1.58
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2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
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1.00
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15
2.1
15
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70
0
3
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1.03
342642--342675
16
2.1
16
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0
50
44
23
2
29
1.68
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2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
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1.00
343384--343426
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2
100
0
86
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0
0
48
1.00
347188--347218
13
2.5
13
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5
55
19
19
16
45
1.86
353027--353055
2
14.5
2
100
0
58
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0
0
48
1.00
365712--365786
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2.1
35
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9
109
45
16
13
25
1.83
370426--370451
7
3.7
7
100
0
52
88
0
0
11
0.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
376051--376081
15
2.1
15
93
0
53
35
25
16
22
1.94
379381--379478
32
2.8
37
71
15
98
23
14
10
52
1.72
381925--381953
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
387795--387840
21
2.3
21
75
17
53
71
0
2
26
0.97
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2.0
17
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50
33
3
9
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1.47
389842--389866
9
2.8
9
100
0
50
92
0
0
8
0.40
401160--401225
31
2.1
31
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89
27
18
21
33
1.96
401234--401356
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2.1
59
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162
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16
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409744--409788
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3.2
14
84
12
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66
0
2
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1.04
415052--415146
31
3.1
29
73
18
86
41
14
10
33
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433