Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  377  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117921480--117921611
29
4.6
29
91
0
201
26
15
32
25
1.95
117924688--117924728
21
2.0
20
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4
55
48
19
0
31
1.49
117931838--117931953
17
6.4
17
72
21
76
30
2
2
64
1.20
117931830--117931950
18
6.7
18
72
18
83
31
2
2
63
1.20
117931844--117931951
37
2.9
36
80
13
96
31
2
1
63
1.19
117931844--117931947
21
5.0
21
71
16
76
32
2
1
62
1.21
117931837--117931949
60
2.0
55
84
8
145
30
2
2
63
1.22
117931832--117931953
55
2.2
55
81
11
144
31
2
2
63
1.21
117931882--117931955
23
3.2
24
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18
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31
2
1
64
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117944280--117944702
44
9.6
44
89
3
609
30
15
26
26
1.96
117946363--117946483
18
6.7
18
73
18
92
32
2
1
63
1.17
117946377--117946480
21
5.0
21
71
16
76
32
2
1
62
1.21
117946370--117946482
60
2.0
55
86
8
154
31
2
1
63
1.18
117946365--117946486
55
2.2
55
83
11
153
32
2
1
63
1.18
117946415--117946488
23
3.2
24
72
18
68
31
2
1
64
1.15
117947794--117947893
24
4.1
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72
20
104
59
3
10
28
1.45
117947842--117947914
23
3.3
20
73
17
56
63
2
8
26
1.36
117947839--117947995
27
6.4
27
64
20
92
62
1
10
24
1.38
117947807--117947974
48
3.6
47
83
5
205
60
2
11
25
1.42
117947839--117947974
21
6.0
22
68
18
75
61
2
11
25
1.41
117947931--117947992
26
2.4
25
78
7
70
66
1
8
24
1.28
117950833--117950909
9
8.3
9
72
18
52
29
1
0
68
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117950855--117950900
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3.7
13
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11
60
30
0
0
69
0.89
117950829--117950952
65
1.9
65
80
6
144
32
1
1
64
1.13
117950852--117951093
52
4.7
52
75
9
196
29
4
4
61
1.36
117950852--117951140
26
11.4
24
70
14
156
29
4
5
61
1.37
117950894--117951093
108
1.9
107
81
7
244
30
5
6
59
1.43
117950894--117951093
82
2.5
79
75
12
190
30
5
6
59
1.43
117951101--117951150
22
2.2
23
78
3
57
20
2
8
70
1.23
117951185--117951248
25
2.5
26
92
2
103
31
6
1
60
1.30
117955902--117955968
1
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1
72
0
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7
4
1
0.75
117955902--117955968
12
5.5
12
82
7
73
86
7
4
1
0.75
117955920--117955955
6
5.8
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93
6
63
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13
0
0
0.58
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1.9
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0
203
19
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10
48
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117957077--117957357
99
2.8
99
82
2
350
30
18
22
28
1.97
117957179--117957934
143
5.3
143
86
2
1023
31
19
21
27
1.97
117957179--117957934
287
2.6
287
91
0
1201
31
19
21
27
1.97
117958330--117958372
14
3.1
15
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21
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32
1.77
117959544--117959633
43
2.1
44
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2
128
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3
3
63
1.27
117959588--117959836
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9.5
26
75
7
209
30
5
5
59
1.43
117959637--117959854
54
4.2
52
75
12
157
29
5
5
59
1.42
117959606--117959817
108
2.0
106
81
7
250
31
6
5
57
1.47
117959839--117959868
7
4.3
7
100
0
60
26
0
0
73
0.84
117959906--117959969
25
2.5
26
84
2
85
31
6
3
59
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117965515--117965572
30
2.0
29
90
10
91
34
1
1
62
1.16
117965518--117965584
30
2.2
29
80
12
73
35
2
1
59
1.22
117970598--117970657
24
2.5
24
75
2
68
35
3
6
55
1.43
117978197--117978324
65
2.0
65
96
0
238
42
8
17
32
1.79
117983311--117983370
26
2.3
27
83
13
72
28
5
1
65
1.23
117986884--117986908
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
117990368--117990403
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19
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22
8
11
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1.59
117991205--117991256
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2.2
24
100
0
104
53
5
15
25
1.63
117997675--117997718
19
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0
52
56
0
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0
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1
1
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1.17
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11
52
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2
2
63
1.19
117998051--117998129
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2.7
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41
1
1
55
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117998062--117998150
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3.0
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79
12
105
37
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2
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0
0
38
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6
0
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1.9
14
100
0
54
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0
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0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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59
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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266
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28
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.8
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0
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31
24
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433