Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  281  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87524423--87524469
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24
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2.9
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0
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0
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87533800--87534158
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1
569
31
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29
30
1.87
87533802--87534178
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147
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578
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29
1.87
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29
29
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2.9
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245
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26
1.99
87542716--87542923
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246
23
22
27
26
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1.87
87546757--87547106
95
3.7
97
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8
497
32
8
28
30
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
16
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3
0
30
1.06
87554171--87554530
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7.4
49
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0
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29
30
1.87
87554184--87554562
195
1.9
194
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1.87
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0
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22
20
18
37
1.94
87579311--87579374
24
2.6
24
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2
110
21
20
18
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1.93
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0
0.65
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15.3
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21
28
1.96
87583326--87584030
138
5.1
138
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21
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1.96
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310
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17
28
26
1.98
87584194--87584691
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11.4
44
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736
27
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22
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87585363--87585392
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80
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44
2.5
44
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4
148
29
22
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87588919--87588962
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2
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0
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0
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48
1.23
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99
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23
44
1.82
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24
2.3
26
77
20
66
51
17
1
28
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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22
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0
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1.00
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139
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1.98
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1.80
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26
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1.98
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1.99
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40
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26
28
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87693067--87693233
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23
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107
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2.0
13
100
0
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30
0
7
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87772082--87772212
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44
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0
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0
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1.99
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25
100
0
100
28
24
0
48
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433