Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  23  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2
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51
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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19
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133
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0
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1.93
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3.7
44
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152
25
23
19
31
1.98
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4.4
87
82
3
435
19
22
22
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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13
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18
23
22
35
1.95
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173
2.2
175
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469
19
22
22
36
1.95
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45
4.6
45
79
10
168
18
22
23
35
1.96
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2.2
20
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19
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1.74
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2.9
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149
22
27
22
28
1.99
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3.8
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7
164
22
26
22
28
1.99
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4.2
40
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4
173
23
26
21
28
1.99
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3
16
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0
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3
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3
16
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1.67
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1.57
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10
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1.56
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200
48
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10
37
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6349091--6349127
13
2.8
13
88
12
58
40
0
32
27
1.57
6350582--6350628
14
3.4
14
78
0
58
27
42
0
29
1.56
6350647--6350704
26
2.2
26
96
0
107
36
34
3
25
1.73
6355465--6355492
14
2.0
14
100
0
56
21
14
21
42
1.88
6355518--6356110
143
4.1
142
88
4
764
31
17
14
35
1.91
6355518--6356110
287
2.1
286
85
5
779
31
17
14
35
1.91
6357424--6357476
26
2.0
26
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7
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60
7
5
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1.46
6357489--6357574
26
3.3
26
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3
100
61
6
1
30
1.29
6357500--6357647
27
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13
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60
6
3
29
1.37
6357667--6357765
26
3.8
25
72
16
69
61
5
4
29
1.35
6357719--6357809
43
2.1
44
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2
121
65
2
3
28
1.20
6358151--6358203
26
2.0
27
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10
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7
3
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1.34
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2
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100
0
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51
0
0
48
1.00
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13
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13
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0
50
16
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44
8
1.76
6362250--6362616
3
118.0
3
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14
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1.32
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17
2.5
17
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0
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2
2
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1.22
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3
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1.33
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145
2.8
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553
32
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1.36
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14
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0
7
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1.29
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3
54.0
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16
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28
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157
3.0
153
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5
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32
15
19
32
1.94
6375451--6375928
80
6.2
76
85
6
586
31
15
19
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6375714--6375986
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3.9
66
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5
262
29
16
21
31
1.95
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17
2.4
17
83
0
55
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2
2
58
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30
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29
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19
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31
2
5
60
1.33
6377775--6378070
3
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3
71
13
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4
3
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1.33
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2
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0
5
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9
151
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0
6
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1.23
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17
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0
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0
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0
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28
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1.14
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3
0
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1.12
6383163--6383217
26
2.1
27
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6
78
23
14
23
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6384704--6384839
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26
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1.78
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16
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0
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18
1.50
6387936--6387970
10
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1.22
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14
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12
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0
31
0
0.89
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22
2.3
22
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10
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68
0
32
0
0.90
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0
29
0
0.88
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6
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100
0
50
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0
16
0
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20
2.3
19
80
4
52
72
0
27
0
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6388342--6388370
10
2.7
11
94
5
51
34
0
3
62
1.12
6388747--6389753
136
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134
94
1
1665
57
6
8
28
1.52
6389412--6389468
30
1.9
30
85
0
78
64
5
5
24
1.35
6388747--6389753
270
3.8
267
93
3
1672
57
6
8
28
1.52
6390002--6390665
200
3.3
200
96
0
1247
39
11
6
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1.68
6396053--6396412
123
2.9
122
94
2
618
23
20
3
53
1.60
6396389--6396421
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16
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0
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0
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50
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2.9
25
82
0
90
20
25
18
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433