Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  420  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128708373--128708459
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1
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1.17
128711818--128711903
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95
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1
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0
0
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2.0
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36
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3
80
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2
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2.9
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50
83
0
13
2
0.74
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22
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2.5
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23
19
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3.5
43
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20
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1.37
128793000--128793047
12
3.8
12
76
10
51
27
6
4
62
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128793215--128793255
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2.0
21
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0
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24
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2
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128793217--128793262
21
2.2
21
84
0
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6
4
60
1.40
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4
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13
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16
20
1.78
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2.3
38
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0
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16
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50
0
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0
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2
0
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18
0
60
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0
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1.9
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66
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1.28
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80
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3.8
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6
27
1.38
128813811--128813930
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2.8
44
76
7
138
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22
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4.7
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15
50
15
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1.37
128815349--128815396
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51
27
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1.38
128815565--128815605
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2.0
21
90
0
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24
7
2
65
1.30
128815567--128815612
21
2.2
21
84
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1.40
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10
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1.77
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15
2.0
15
100
0
60
46
6
6
40
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128836672--128836715
22
2.0
22
100
0
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36
1.55
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19
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71
0
4
24
1.03
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2.0
20
85
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53
50
2
5
42
1.37
128840229--128840282
28
1.9
28
82
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53
1
3
40
1.29
128840270--128840328
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66
1
0
32
1.02
128840393--128840467
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2.5
30
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57
6
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1.43
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21
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2.2
42
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1.24
128909536--128909563
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0
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0
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2.5
20
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3
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65
1
1
30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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3.1
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5
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13
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1.82
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0
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0
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0
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0
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0
0
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128947788--128947941
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128953906--128954039
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26
5.2
26
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2
227
35
24
5
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1.78
128959676--128959809
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2.6
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2
227
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24
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1.78
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2.1
19
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4
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5
10
25
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
119
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31
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6
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
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88
5
224
30
18
22
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433