Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  126  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38604403--38604510
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2.4
45
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4
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47
2.1
47
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3
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25
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1.94
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2.0
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0
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2.1
17
88
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37
5
0
57
1.23
38605635--38605724
38
2.3
39
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114
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56
1.30
38612966--38613196
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4.9
48
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7
240
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19
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32
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16
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1.95
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2.3
20
84
0
56
36
13
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10.4
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7
205
31
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2.0
134
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3
343
32
20
8
38
1.83
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52
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120
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12
26
1.90
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27
5.6
27
76
4
135
42
22
7
27
1.81
38630364--38630551
81
2.3
79
77
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191
39
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9
28
1.85
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25
2.3
25
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0
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29
25
18
25
1.98
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3.3
20
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0
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10
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26
5.3
26
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174
27
22
24
25
1.99
38631548--38631683
52
2.7
50
89
7
197
27
22
24
25
1.99
38631816--38631907
42
2.2
42
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15
19
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1.93
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31
4.6
31
87
6
171
30
20
23
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
39
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0
150
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17
21
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29
2.6
29
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4
105
28
16
29
25
1.97
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3.4
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13
21
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1.91
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78
2.9
78
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1.94
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40
3.4
40
84
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148
30
13
21
35
1.91
38649809--38650044
78
2.9
78
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33
14
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30
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1.79
38653361--38653408
9
5.3
9
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51
25
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1.65
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1.8
88
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1.81
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31
2.3
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30
1.82
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309
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25
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1.88
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2.0
28
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16
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44
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35
17
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34
1.87
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2.3
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1.22
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0
0
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12
3.0
12
83
0
54
44
19
19
16
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38689597--38689627
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0
0
50
1.00
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19
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28
1.99
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19
26
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1.99
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1
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21
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3
254
27
21
21
28
1.99
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20
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0
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20
11
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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28
1.99
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1.98
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1.98
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108
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1.99
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3.6
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22
22
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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21
31
28
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
24
18
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433