Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  45  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12116579--12116628
3
16.7
3
82
0
64
66
6
2
26
1.26
12116582--12116628
12
3.9
12
97
0
85
65
6
2
25
1.27
12117576--12117619
5
9.0
5
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14
56
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0
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2
0.83
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46
12.0
45
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10
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22
24
15
37
1.93
12122628--12123021
84
4.6
85
85
12
556
23
24
15
36
1.94
12122496--12123021
130
4.0
130
94
2
863
22
24
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37
1.93
12126060--12126225
25
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90
36
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23
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1.95
12126154--12126224
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3.0
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23
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1.93
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58
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84
0.83
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100
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5
224
32
21
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1.94
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2.5
20
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75
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0
0
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13
140
20
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29
32
1.96
12151630--12151763
46
2.8
48
74
6
139
26
17
29
26
1.97
12152664--12152706
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21.5
2
100
0
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48
0
0
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34
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3.5
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112
29
25
16
29
1.96
12166254--12166352
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
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1.96
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4.9
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2
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19
1.9
19
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0
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21
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2.1
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60
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3.1
8
100
0
50
24
0
0
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0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
19
19
42
1.90
12189670--12189828
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3.2
50
77
13
168
19
18
18
43
1.88
12189639--12189873
45
5.1
45
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211
21
17
17
42
1.89
12189651--12189880
96
2.5
91
80
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214
21
18
17
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12190227--12190285
26
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25
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30
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2
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2
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0
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51
0
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10
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1.48
12206275--12206326
20
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20
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1.50
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1.9
30
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2.1
23
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30
0
0
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59
0
0
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2.0
21
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59
54
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40
1.21
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70
15
0
15
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2.2
19
95
0
75
33
0
16
50
1.46
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2.3
41
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15
49
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30
2.1
30
100
0
124
38
16
9
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12247343--12247390
19
2.6
19
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35
2
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10
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10
100
0
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7
0
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1.09
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14
2.0
15
93
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51
27
6
10
55
1.59
12250818--12250991
31
5.6
31
91
2
269
27
19
27
25
1.99
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47
2.7
48
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30
15
25
29
1.95
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3.7
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139
31
13
26
28
1.94
12251109--12251223
42
2.7
43
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155
31
14
26
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6
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1
1
25
1.06
12287172--12287217
22
2.0
23
91
4
76
10
4
6
78
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0
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0
0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12422050--12422164
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38
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433