Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  252  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78668284--78668375
37
2.5
37
75
10
98
34
13
16
35
1.87
78669182--78669235
22
2.5
22
87
6
74
44
12
5
37
1.66
78669766--78669857
46
2.0
46
95
0
166
29
20
18
31
1.96
78670357--78670405
25
2.0
25
83
0
62
73
4
2
20
1.10
78670364--78670406
19
2.3
18
84
7
59
74
4
0
20
1.00
78670915--78670955
20
2.0
22
90
9
68
75
2
9
12
1.13
78670915--78670964
22
2.3
22
83
13
59
76
2
12
10
1.11
78675128--78675335
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
78675128--78675333
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
78683452--78683635
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
78683492--78683680
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
78691612--78691795
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
78710466--78710609
40
3.6
40
83
5
157
27
27
20
25
1.99
78714218--78714327
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
78722601--78722768
40
4.2
40
79
1
158
22
27
23
26
2.00
78722617--78722766
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
78727076--78727221
40
3.7
40
90
0
231
23
26
26
23
2.00
78729263--78729347
25
3.4
25
78
4
91
34
21
21
23
1.97
78732121--78732221
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
78749907--78750090
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
78749947--78750135
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
78753045--78753251
40
5.2
39
82
2
209
25
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78753045--78753250
79
2.6
80
82
4
238
25
26
22
25
2.00
78757271--78757322
25
2.1
25
82
7
61
50
3
0
46
1.20
78757445--78757514
34
2.1
34
97
0
131
45
7
7
40
1.59
78757640--78757678
19
2.1
19
90
0
60
33
5
0
61
1.18
78759260--78759335
40
1.9
39
89
2
116
26
30
13
30
1.94
78768931--78768960
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
78769491--78769529
15
2.7
15
88
4
53
10
51
15
23
1.73
78770679--78770717
21
1.9
19
85
10
51
25
5
2
66
1.25
78770730--78770794
29
2.3
29
79
7
73
27
3
3
66
1.22
78770814--78770868
27
2.1
26
86
3
74
32
5
1
60
1.30
78770814--78770866
26
2.0
26
85
7
70
32
5
1
60
1.31
78774694--78774740
19
2.5
19
89
6
69
25
19
6
48
1.72
78781984--78782019
6
6.0
6
100
0
72
83
0
16
0
0.65
78782962--78783430
44
10.5
44
73
5
330
31
19
21
27
1.97
78784092--78784147
21
2.5
24
77
11
64
21
5
5
67
1.31
78785013--78785088
20
3.7
20
76
5
71
31
6
2
59
1.37
78785112--78785178
36
1.9
33
85
8
89
32
5
0
61
1.20
78785149--78785202
27
1.9
27
81
7
63
29
5
1
62
1.28
78785209--78785276
22
3.2
21
73
20
61
30
11
1
55
1.45
78788411--78788460
18
2.7
19
78
9
59
70
4
0
26
1.05
78788689--78788745
19
3.0
20
75
10
57
54
0
0
45
0.99
78788926--78788968
17
2.6
16
78
7
50
46
2
0
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78791865--78791909
3
14.7
3
95
4
81
66
0
0
33
0.92
78793179--78793224
20
2.2
21
80
7
58
21
19
4
54
1.61
78794397--78794533
66
2.1
65
82
4
159
13
24
18
43
1.87
78796675--78796779
29
3.6
29
77
2
86
25
33
17
23
1.96
78796713--78796835
58
2.1
59
87
3
178
25
30
15
28
1.96
78796734--78796835
29
3.5
29
95
0
186
26
29
14
29
1.95
78804653--78804757
29
3.6
29
77
2
86
25
33
17
23
1.96
78804691--78804813
58
2.1
59
87
3
178
25
30
15
28
1.96
78804712--78804813
29
3.5
29
95
0
186
26
29
14
29
1.95
78810706--78810955
40
6.6
39
69
11
164
33
20
18
27
1.96
78810694--78810958
75
3.5
75
91
0
422
32
20
19
27
1.97
78810707--78810896
35
5.1
35
71
16
123
32
20
18
28
1.96
78817563--78817594
14
2.4
14
90
10
50
21
9
28
40
1.84
78817664--78817792
51
2.5
51
81
5
127
28
19
24
27
1.99
78817701--78817842
51
2.8
50
83
8
153
28
16
27
27
1.97
78829534--78829711
49
3.6
48
78
6
164
30
19
26
23
1.98
78834442--78834542
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
78834471--78834546
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
78842278--78842378
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
78842307--78842382
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
78844070--78844129
24
2.5
24
97
0
111
46
8
18
26
1.77
78844934--78845016
31
2.7
31
94
3
143
27
25
16
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78845236--78845304
25
2.8
25
86
2
95
27
21
21
28
1.99
78846114--78846175
27
2.3
27
80
5
72
22
24
17
35
1.95
78846206--78846415
27
7.7
27
78
4
161
30
9
20
39
1.84
78846214--78846415
54
3.7
54
77
7
203
31
9
18
40
1.83
78846313--78846455
27
5.3
27
72
12
107
30
11
20
37
1.88
78846447--78846538
27
3.4
27
90
0
139
42
9
21
26
1.84
78847742--78847779
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
78849405--78849473
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
78856012--78856080
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
78860299--78860329
3
10.3
3
92
0
53
29
0
38
32
1.57
78861553--78861609
29
1.9
30
82
10
73
1
26
5
66
1.22
78865153--78865203
26
2.0
25
84
3
66
74
5
7
11
1.21
78870827--78870972
44
3.3
44
69
11
120
38
8
17
35
1.80
78873344--78873614
46
5.8
49
80
11
243
23
30
18
27
1.97
78880867--78881048
48
3.9
47
79
9
212
29
25
19
25
1.99
78880874--78881048
90
1.9
90
89
2
271
29
25
19
25
1.99
78882435--78882809
187
2.0
186
96
0
687
36
10
18
34
1.85
78887293--78887397
27
3.9
27
85
7
108
39
15
9
36
1.80
78887308--78887397
27
3.3
26
84
9
110
40
15
10
34
1.81
78887308--78887414
54
2.0
54
80
7
119
38
18
10
32
1.85
78887403--78887614
27
7.9
27
88
2
255
27
23
8
40
1.84
78887605--78887877
27
10.1
27
75
5
194
40
16
9
32
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78887592--78887786
81
2.4
81
89
0
284
40
18
8
31
1.82
78887915--78887992
27
2.9
27
77
11
88
35
21
20
21
1.96
78889141--78889188
25
1.9
25
95
0
87
37
25
12
25
1.91
78889225--78889354
20
6.6
20
92
1
208
33
12
21
32
1.90
78889225--78889354
59
2.2
60
92
2
226
33
12
21
32
1.90
78889401--78889569
25
7.0
24
86
6
211
28
21
22
27
1.99
78889400--78889569
49
3.5
47
82
8
209
28
21
22
27
1.99
78889761--78889824
31
2.1
31
84
0
83
40
12
23
23
1.88
78891475--78891526
14
3.4
14
71
19
50
44
13
21
21
1.86
78891461--78891526
32
2.1
32
97
0
123
43
12
21
22
1.85
78891456--78891512
18
3.4
18
67
18
50
45
10
21
22
1.82
78891675--78891750
21
3.6
21
69
25
70
56
2
13
27
1.50
78891685--78891769
42
2.0
42
100
0
170
55
2
14
28
1.51
78898056--78898156
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
78906015--78906115
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
78917295--78917335
12
3.3
12
86
3
55
46
0
7
46
1.30
78917295--78917344
25
2.0
25
84
0
64
44
0
12
44
1.41
78918826--78918865
20
2.0
20
95
0
71
37
10
0
52
1.35
78919228--78919257
14
2.1
14
93
0
51
30
13
16
40
1.87
78921970--78922012
5
8.6
5
94
0
68
13
0
4
81
0.84
78931004--78931044
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
78934185--78934223
10
3.8
10
83
6
51
30
2
2
64
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78934185--78934226
21
2.0
20
90
4
66
33
2
4
59
1.31
78938529--78938572
23
2.0
22
86
13
63
27
0
22
50
1.50
78938529--78938572
22
2.0
23
86
13
65
27
0
22
50
1.50
78938554--78938588
15
2.3
15
85
14
54
20
0
22
57
1.41
78938584--78938614
16
2.0
16
93
6
55
22
0
32
45
1.53
78938952--78939006
26
2.1
26
96
0
101
63
16
5
14
1.48
78939330--78939554
114
2.0
114
93
0
387
34
17
20
28
1.95
78943582--78943620
18
2.2
18
90
0
60
48
7
2
41
1.45
78943999--78944062
25
2.6
25
79
0
74
21
21
20
35
1.96
78945472--78945516
16
2.8
16
80
12
56
20
4
4
71
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433