Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  383  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119665883--119665912
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4.1
7
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4
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40
0
0
60
0.97
119668917--119669006
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1.9
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116
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0
12
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1.39
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7
3.6
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0
50
28
0
12
60
1.32
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30
3.2
30
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2
142
32
42
16
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1.78
119671470--119671542
15
4.9
14
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21
69
34
42
15
8
1.76
119671621--119671663
18
2.4
18
88
0
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18
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6
46
1.75
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6.0
126
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0
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20
18
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1.95
119675776--119676523
251
3.0
252
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0
1239
25
20
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1.95
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2.0
377
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0
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25
20
18
35
1.95
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19
2.1
19
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0
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45
20
2
32
1.64
119676645--119676717
19
3.8
19
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7
67
45
21
2
30
1.66
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7
8.3
7
76
14
57
50
36
0
13
1.42
119676774--119676831
14
4.1
15
75
20
63
50
36
0
13
1.42
119676773--119676831
21
2.8
21
100
0
118
49
35
0
15
1.45
119677059--119677104
21
2.1
22
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60
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0
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30
1.12
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50
2.5
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2
197
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15
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26
1.94
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31
4.8
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6
171
29
18
27
25
1.98
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31
5.5
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83
8
125
32
17
26
23
1.97
119680181--119680303
47
2.7
46
84
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149
30
15
22
30
1.95
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42
2.0
43
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2
123
37
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25
22
1.92
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30
2.0
30
100
0
122
16
16
13
54
1.72
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17
2.1
17
94
0
61
28
8
17
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119692124--119692186
30
2.1
30
90
0
99
58
11
3
26
1.47
119697648--119697776
40
3.3
39
77
8
127
33
25
17
24
1.96
119698003--119698049
24
2.0
23
84
12
60
44
19
0
36
1.51
119701428--119701472
18
2.5
18
82
13
65
57
2
0
40
1.11
119702189--119702230
3
14.0
3
100
0
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0
0
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0.92
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100
0
92
65
0
0
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0.93
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3
15.3
3
100
0
92
67
0
0
32
0.91
119710664--119710821
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1.9
82
85
5
219
40
9
7
42
1.66
119712618--119712648
2
15.5
2
100
0
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51
0
0
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1.00
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2.9
22
81
9
60
68
3
3
25
1.18
119715814--119715912
52
1.9
52
93
0
171
34
19
14
32
1.91
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3
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3
65
12
89
31
9
3
56
1.48
119721829--119721875
20
2.3
21
96
3
87
29
10
0
59
1.31
119721830--119721945
49
2.4
49
78
5
119
31
10
2
55
1.47
119723278--119723314
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
119727093--119727223
25
5.2
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8
113
40
22
22
13
1.90
119727118--119727223
49
2.1
51
82
6
128
40
22
23
13
1.89
119727143--119727224
26
3.3
26
88
6
125
40
24
20
14
1.90
119728238--119728291
26
2.0
27
82
7
65
37
7
3
51
1.48
119732181--119732205
9
2.8
9
100
0
50
24
12
32
32
1.91
119734743--119734783
16
2.4
18
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11
52
68
2
12
17
1.31
119735695--119735729
12
2.9
12
91
0
52
80
0
5
14
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119737742--119737900
27
5.9
27
80
11
166
35
23
22
18
1.95
119737742--119737900
54
3.0
54
88
2
223
35
23
22
18
1.95
119740648--119740817
93
1.8
92
92
1
286
27
28
21
21
1.99
119740640--119740819
46
3.9
46
80
5
211
27
28
21
22
1.99
119742296--119742403
26
4.2
26
90
4
173
36
23
7
33
1.83
119744259--119744288
15
2.1
14
93
6
51
0
10
0
90
0.47
119746988--119747017
15
2.0
15
100
0
60
53
13
0
33
1.40
119752147--119752221
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2.5
30
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2
96
30
10
9
49
1.69
119752147--119752208
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2.0
31
87
3
90
30
11
6
51
1.63
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2.0
28
82
13
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25
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3
67
1.23
119752627--119752800
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2.9
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186
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10
18
22
1.80
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0
100
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28
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5
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28
20
29
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1.98
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22
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2.0
23
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12
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45
10
6
36
1.65
119755374--119755418
23
2.0
23
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13
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0
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23
17
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100
0
56
50
14
17
17
1.79
119761234--119761341
44
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3
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0
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27
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119766571--119766677
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1.9
57
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1
153
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19
7
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
19
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
20
23
33
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433