Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  139  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
42793530--42793566
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11
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3
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0
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0
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0
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0
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0.99
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0
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0
6
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20
2.0
20
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13
50
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0
4
47
1.23
42795557--42795599
21
2.0
21
90
0
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0
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2.0
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7
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2.3
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3
1
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20
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4
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1.41
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13
2.5
15
90
9
56
5
0
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68
1.11
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11
2.7
11
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53
0
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3
90
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15
2.3
15
90
5
52
0
5
2
91
0.51
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55
2.8
55
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235
3
5
17
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2.4
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0
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1.11
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16
2.5
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70
1.18
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10
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0
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80
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12
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33
18
18
29
1.95
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1.9
164
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3
448
33
19
18
28
1.96
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2.0
89
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230
35
18
19
26
1.95
42808185--42808452
75
3.6
74
88
3
371
32
20
17
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
42808409--42808504
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2.0
49
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0
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20
15
30
1.94
42808337--42808576
121
2.0
121
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1
392
34
18
15
31
1.92
42808461--42808695
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3.2
72
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11
271
35
16
16
31
1.91
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1.9
54
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9
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18
15
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1.91
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140
3.5
140
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2
862
37
19
17
25
1.94
42808925--42809030
54
1.9
54
83
9
135
37
18
15
28
1.91
42809021--42809184
71
2.3
70
83
7
206
41
20
15
22
1.90
42809060--42809287
122
1.9
124
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370
36
24
14
24
1.93
42809293--42809592
71
4.1
72
83
8
381
33
21
16
28
1.95
42809184--42809580
149
2.9
134
79
13
403
32
22
16
27
1.95
42809789--42810053
75
3.6
73
85
7
372
30
21
18
29
1.97
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4.8
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251
33
20
18
27
1.96
42809320--42810463
465
2.4
465
91
4
1789
32
21
16
28
1.96
42810195--42810300
54
1.9
55
83
5
135
38
19
15
26
1.91
42810280--42810314
14
2.5
14
95
0
61
60
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17
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14
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14
100
0
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13
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164
2.2
164
94
0
632
31
21
17
29
1.96
42810464--42810609
76
1.9
77
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2
195
30
21
17
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1.96
42815628--42815663
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3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
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37
2.6
38
75
20
95
57
4
4
32
1.41
42818258--42818292
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2.2
16
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10
54
0
8
2
88
0.61
42818207--42818368
58
2.8
56
93
5
272
3
5
17
74
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
42818285--42818369
16
5.7
16
73
18
58
3
3
21
71
1.16
42818283--42818325
17
2.6
17
89
10
63
4
2
23
69
1.18
42818316--42818350
17
2.1
17
89
10
54
0
8
2
88
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125
29
27
13
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1.95
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3.5
29
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125
29
27
13
28
1.95
42841362--42841407
16
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17
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58
69
0
8
21
1.15
42852735--42852766
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2.0
16
100
0
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1.50
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2.0
30
84
6
79
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6
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34
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
0
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0
0
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1.00
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0
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25
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4
0
64
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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134
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1.9
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0
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22
29
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43019578--43019734
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1.88
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20
23
15
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433