Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  67  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19328266--19328290
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1.9
13
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0
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2.0
24
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0
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27
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1.98
19329050--19329265
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2.7
82
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100
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0
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19332669--19332776
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0
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2.0
30
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0
0
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0
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0
0
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4
15
1.14
19352316--19352365
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22
26
25
2.00
19354341--19354559
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2.8
78
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264
25
22
26
25
2.00
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35
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102
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11
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20
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39
0
2
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3
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2.1
22
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62
0
59
0
40
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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40
0
0
60
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1024
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16
19
33
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19382667--19383324
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5
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31
16
18
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221
2.9
221
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943
31
16
19
32
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19384187--19384230
20
2.1
21
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29
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1.12
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17
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17
10
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0
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2.1
22
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22
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17
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2
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61
1.29
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2.3
17
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2
40
1.44
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20
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28
1.69
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31
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29
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2
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0
0
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2.0
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23
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3
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2.0
25
84
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36
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42
1.72
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12
2.4
13
94
5
53
40
3
0
56
1.16
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60
2.2
58
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9
142
49
3
3
42
1.39
19416260--19416435
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3.8
46
80
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225
21
21
28
28
1.98
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93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19419386--19419454
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3.0
30
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10
17
15
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3.8
46
78
13
189
20
21
29
28
1.98
19421847--19422020
46
3.8
46
79
13
214
20
21
29
28
1.98
19424351--19424418
15
4.5
15
83
0
82
11
17
13
57
1.65
19424343--19424428
30
3.0
30
80
11
90
10
17
15
56
1.65
19426188--19426360
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3.8
46
79
14
214
20
21
29
28
1.98
19429309--19429377
15
4.6
15
83
0
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11
17
13
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1.64
19429300--19429387
30
3.0
30
81
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99
10
17
15
56
1.66
19431767--19431942
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
19431763--19431934
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1.8
93
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20
21
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26
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27
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16
21
26
1.95
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9
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9
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3
63
22
0
22
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1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
50
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25
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1.99
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21
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24
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20
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1.33
19475225--19475282
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1.33
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24
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2.00
19486183--19486364
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2.00
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0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.92
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27
22
26
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19538739--19538848
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1.99
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181
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22
26
23
2.00
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26
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24
1.99
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0
100
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2.3
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9
178
27
26
20
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433