Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  69  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19917437--19917471
15
2.2
16
90
5
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0
20
2
0.90
19929131--19929173
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2.0
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0
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19933447--19933480
18
1.9
18
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17
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29
26
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19939270--19939309
13
3.1
13
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0
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15
30
35
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19948038--19948068
15
2.1
15
93
0
53
25
16
12
45
1.83
19958326--19958358
13
2.6
13
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0
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48
1.40
19959894--19960031
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57
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206
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19965502--19965570
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2
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2.0
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19968361--19968672
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8.0
39
94
0
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21
25
29
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1.99
19974278--19974511
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3.0
77
91
3
391
21
24
30
23
1.99
19974278--19974511
38
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39
90
2
375
21
24
30
23
1.99
19976969--19976994
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2.2
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100
0
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7
23
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25
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4
60
51
0
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1.33
19986766--19986791
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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0
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16
1.92
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40
2.2
40
89
0
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37
28
18
14
1.91
20007990--20008060
35
2.0
35
97
0
133
35
21
22
21
1.96
20014095--20014146
23
2.3
23
83
9
63
21
11
3
63
1.43
20015852--20015899
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
20015848--20015903
24
2.3
24
81
6
69
66
1
1
30
1.12
20015848--20015899
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20016051--20016099
25
2.0
25
87
0
71
48
6
10
34
1.62
20016136--20016267
25
5.6
25
72
12
91
56
3
4
34
1.37
20016129--20016192
25
2.4
27
71
10
69
60
1
3
34
1.22
20016814--20016943
30
4.3
30
94
0
215
21
3
46
27
1.68
20017554--20018048
88
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87
81
7
475
37
19
16
26
1.92
20017946--20017974
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
20017954--20018196
75
3.3
75
82
9
300
35
20
18
25
1.95
20018182--20018212
16
1.9
16
93
0
53
64
6
12
16
1.47
20017880--20019210
249
5.6
235
75
14
898
34
21
17
26
1.95
20018202--20019844
153
10.4
150
74
14
873
33
21
17
27
1.96
20018317--20018581
76
3.5
76
86
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372
29
21
17
30
1.97
20018516--20018684
89
1.9
89
90
0
266
37
19
16
26
1.93
20017993--20019645
491
3.4
475
73
15
1265
33
21
17
27
1.96
20018600--20019128
73
6.9
73
73
15
318
32
22
17
27
1.96
20018673--20018832
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1.8
87
89
0
248
33
21
16
28
1.96
20017728--20019128
402
3.5
385
78
12
1163
34
21
17
26
1.95
20018913--20019128
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2.9
74
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321
31
26
18
24
1.97
20019244--20019285
19
2.2
19
95
0
75
28
28
26
16
1.97
20019365--20019844
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6.4
74
90
3
671
30
19
18
31
1.96
20022030--20022063
14
2.4
14
90
9
52
0
11
2
85
0.71
20025901--20025948
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15
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60
62
2
4
31
1.26
20025897--20025948
8
6.5
8
78
8
52
63
1
3
30
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20026191--20026326
23
5.6
25
70
16
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57
2
4
35
1.34
20026281--20026326
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
20026873--20026942
30
2.3
30
97
0
131
18
4
48
28
1.67
20027977--20028003
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
20029356--20029572
46
4.7
47
75
14
175
28
18
29
24
1.98
20042636--20042670
17
2.1
17
100
0
70
40
14
5
40
1.69
20051279--20051549
48
5.6
48
81
3
292
29
16
27
26
1.97
20054940--20055061
25
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113
23
20
20
35
1.96
20054977--20055075
50
2.0
50
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128
24
21
19
35
1.96
20054940--20055077
25
5.5
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107
23
20
21
34
1.96
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111
29
18
28
23
1.98
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2.0
22
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26
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10
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29
20
28
21
1.98
20062738--20062792
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2.1
26
100
0
110
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19
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20
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18
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11
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13
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33
0
0
66
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20079521--20079571
20
2.5
20
77
0
57
62
5
1
29
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20079529--20079592
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19
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19
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3
1
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50
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25
20
30
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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          433