Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  43  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11546613--11546713
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2.2
46
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7
116
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18
20
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1.96
11546613--11546697
22
3.7
22
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10
73
30
20
22
27
1.98
11552477--11552769
153
1.9
153
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4
430
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13
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29
1.91
11552470--11552802
154
2.2
154
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5
433
37
14
20
27
1.91
11554021--11554052
16
2.0
16
100
0
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43
18
12
25
1.85
11554413--11554579
59
2.8
59
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1
228
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7
7
34
1.57
11559383--11559523
40
3.6
40
88
5
200
25
29
20
24
1.99
11559383--11559566
39
4.7
40
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5
216
26
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21
23
1.99
11559383--11559566
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82
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218
26
28
21
23
1.99
11567419--11567550
40
3.3
40
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5
189
25
28
21
24
1.99
11569409--11569450
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100
0
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50
0
0
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116
15
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17
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21
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75
0
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16
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26
2.4
24
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8
75
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3
0
28
1.05
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20
2.1
20
83
8
52
70
4
0
25
1.06
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20
2.0
20
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5
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55
2
2
39
1.28
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22
2.0
22
86
9
61
57
4
7
30
1.47
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2
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2
92
0
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46
3
0
50
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18
23
23
34
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11585972--11586121
44
3.5
44
70
9
137
16
23
25
34
1.95
11585928--11586208
43
6.5
45
69
15
173
19
22
22
35
1.96
11586051--11586303
132
1.9
133
80
7
298
20
21
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11586183--11586338
44
3.5
44
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13
118
19
24
21
35
1.96
11606460--11606560
3
33.7
3
100
0
202
0
33
0
66
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26
3.2
26
93
0
141
34
4
23
36
1.76
11612279--11612381
51
2.0
51
100
0
206
53
13
5
27
1.62
11616737--11616767
2
16.0
2
93
6
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48
0
0
51
1.00
11631390--11631462
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2.2
33
87
0
101
49
5
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36
1.56
11633434--11633489
26
2.2
26
96
0
103
32
7
25
35
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27
5.6
27
83
6
184
18
24
22
34
1.96
11635066--11635219
54
2.8
54
92
1
245
18
24
22
35
1.96
11636276--11636701
202
2.1
203
86
2
588
33
9
14
42
1.78
11637429--11637473
20
2.2
20
88
7
65
51
13
13
22
1.75
11637482--11637545
21
3.0
22
77
11
78
57
6
6
29
1.48
11638176--11638251
3
25.3
3
100
0
152
0
32
0
67
0.91
11638326--11638371
21
2.2
21
84
0
56
41
8
21
28
1.83
11640582--11640670
44
2.0
44
97
0
169
29
12
15
42
1.84
11652632--11652704
31
2.4
31
83
4
94
43
19
12
24
1.85
11657447--11657554
44
2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
11663586--11663693
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
11666409--11666467
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
11666438--11666486
26
2.0
24
88
8
71
30
0
6
63
1.19
11666947--11666986
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2.5
17
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2
2
22
1.09
11670803--11670836
17
1.9
17
88
5
50
67
0
2
29
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11671889--11671985
24
3.9
24
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20
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46
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3
42
1.49
11676804--11676835
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
11681040--11681070
5
6.2
5
92
0
53
0
45
19
35
1.51
11681824--11681848
5
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5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
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2.0
24
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38
8
2
51
1.45
11684498--11684541
21
2.0
22
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12
56
54
2
0
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1.12
11685903--11685932
5
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5
96
4
51
16
0
0
83
0.65
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2.0
29
89
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26
12
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16
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11
50
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0
0
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0.88
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23
0
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1.12
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28
0
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1.05
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21
100
0
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4
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1.42
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50
1.30
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42
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26
24
31
17
1.97
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3
37
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11724409--11724463
27
2.0
27
82
6
67
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10
3
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
23
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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48
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11862672--11862738
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0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433