Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  51  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14040297--14040352
26
2.2
26
87
6
78
26
8
5
58
1.50
14042204--14042235
16
1.9
17
93
6
57
43
9
0
46
1.35
14044540--14044619
30
2.7
30
78
1
90
37
21
16
25
1.93
14047566--14047591
5
5.2
5
100
0
52
80
0
19
0
0.71
14051424--14051561
3
46.7
3
79
8
149
29
5
2
63
1.28
14051651--14051803
3
49.7
3
78
15
122
32
1
1
65
1.09
14068957--14069072
45
2.6
44
82
9
137
29
16
22
31
1.96
14069092--14069579
44
10.4
45
67
16
170
29
20
22
27
1.98
14069046--14069512
44
9.8
49
68
19
188
29
20
23
27
1.98
14069046--14069551
143
3.5
143
89
0
746
29
20
22
27
1.99
14069503--14069808
127
2.4
127
91
0
477
35
17
19
26
1.95
14069557--14069750
40
4.7
40
68
13
117
37
19
17
26
1.93
14069602--14069817
44
5.0
44
70
10
106
34
17
19
28
1.95
14069767--14069877
44
2.5
44
75
5
116
35
14
18
31
1.91
14071212--14071271
3
20.0
3
80
13
70
36
1
0
61
1.06
14071268--14071312
23
1.9
24
95
4
83
17
2
4
75
1.07
14074398--14074441
23
1.9
23
95
0
79
34
27
11
27
1.91
14074401--14074458
23
2.5
23
82
0
62
36
29
12
22
1.90
14074572--14074645
37
2.0
37
97
0
139
32
22
16
28
1.96
14077910--14077963
10
5.2
10
80
13
56
50
3
0
46
1.19
14079209--14079273
25
2.6
25
95
4
114
67
4
10
16
1.37
14079526--14079571
21
2.1
21
84
4
56
41
2
4
52
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14079699--14079730
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
14091144--14091188
21
2.1
21
87
0
63
24
17
26
31
1.97
14098310--14098349
21
2.0
21
85
5
55
20
25
40
15
1.90
14098467--14098550
42
2.0
41
93
2
141
15
44
21
19
1.87
14099741--14100008
48
5.6
47
84
4
308
23
28
21
25
1.99
14099790--14100008
94
2.3
95
90
1
332
24
29
20
25
1.99
14099741--14100014
142
1.9
142
88
2
417
24
28
21
25
1.99
14106238--14106298
22
3.1
19
80
15
70
21
9
3
65
1.37
14107882--14107916
12
3.0
12
91
4
54
11
11
0
77
1.00
14111375--14111422
20
2.5
19
86
6
62
52
0
25
22
1.48
14113225--14113404
43
4.3
43
75
11
149
25
14
19
40
1.89
14113306--14113483
43
4.1
43
82
0
167
24
17
19
38
1.92
14113306--14113509
86
2.4
86
80
3
205
24
17
18
39
1.92
14113367--14113509
43
3.3
43
86
0
187
23
18
18
39
1.92
14118001--14118144
43
3.3
43
76
13
154
31
22
19
26
1.98
14118314--14118345
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
14123149--14123274
22
5.7
22
72
9
87
22
27
16
33
1.95
14123159--14123257
44
2.2
44
89
0
144
22
28
15
34
1.94
14123159--14123274
44
2.6
42
82
8
124
22
28
15
33
1.95
14124565--14124600
13
2.8
13
100
0
72
30
16
25
27
1.97
14126655--14126776
44
2.6
47
81
13
155
29
31
18
20
1.96
14126649--14126869
48
4.7
46
76
10
168
26
30
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14138678--14138737
33
1.9
30
86
10
84
56
3
10
30
1.48
14144337--14144412
38
2.0
38
89
5
118
31
21
7
39
1.82
14145717--14145749
2
17.0
2
93
6
59
51
0
0
48
1.00
14150595--14150643
6
8.0
6
95
4
89
18
16
16
48
1.81
14153911--14154119
101
2.0
103
87
8
298
28
17
16
37
1.92
14162842--14162935
49
1.9
49
85
8
129
38
17
17
27
1.91
14165819--14165873
22
2.5
22
96
0
101
49
12
10
27
1.74
14166127--14166186
32
1.9
32
89
3
95
45
26
5
23
1.73
14167092--14167173
42
2.0
42
92
0
137
28
3
30
37
1.74
14167162--14167329
33
5.1
33
76
5
169
29
4
44
21
1.72
14167154--14167329
66
2.7
66
85
1
237
29
4
44
21
1.71
14172509--14172609
38
2.6
38
88
3
139
23
25
25
24
2.00
14172525--14172632
38
2.8
38
88
0
144
20
24
27
27
1.99
14177196--14177236
20
2.0
20
85
0
55
29
24
14
31
1.95
14178784--14179003
46
4.8
45
73
11
142
29
20
28
22
1.98
14180321--14180376
21
2.7
21
88
0
85
14
32
26
26
1.95
14182779--14182814
11
3.2
12
88
11
58
33
0
0
66
0.92
14182936--14182998
30
2.1
30
90
0
99
57
12
3
26
1.51
14183028--14183070
22
2.0
22
95
0
77
60
9
9
20
1.55
14187833--14187880
14
3.5
13
75
10
51
47
10
2
39
1.49
14188144--14188178
12
3.0
12
91
4
54
28
8
14
48
1.73
14196717--14196761
19
2.4
19
96
0
81
20
20
31
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14202539--14202589
23
2.3
21
80
6
57
66
3
1
27
1.20
14202584--14202628
22
2.1
21
84
8
56
64
4
24
6
1.37
14202849--14202881
13
2.5
13
100
0
66
39
6
15
39
1.72
14203323--14203393
31
2.3
30
81
9
81
29
0
25
45
1.54
14207307--14207365
30
2.0
30
96
0
109
57
13
3
25
1.52
14207398--14207440
22
2.0
22
85
0
59
55
9
13
20
1.66
14209263--14209391
64
2.0
64
90
3
206
29
5
15
49
1.67
14212849--14212874
12
2.2
12
100
0
52
38
7
26
26
1.83
14214952--14215160
40
5.2
40
84
2
249
25
22
25
26
2.00
14222664--14222701
2
19.0
2
94
0
67
50
2
0
47
1.15
14222666--14222708
8
5.4
8
94
0
50
48
4
2
44
1.36
14222797--14222825
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
14222766--14222897
39
3.3
40
76
8
126
53
4
5
37
1.44
14223401--14223434
15
2.4
14
95
5
59
5
0
29
64
1.17
14223430--14223463
15
2.3
15
90
10
52
0
8
2
88
0.62
14224273--14224334
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
14224482--14225012
72
6.8
73
75
13
420
32
19
18
29
1.95
14224851--14225012
74
2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
14224679--14225336
165
4.0
164
90
3
947
33
20
18
27
1.96
14225006--14225177
74
2.3
76
85
6
242
32
20
19
27
1.97
14225157--14225191
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
14225167--14225620
72
6.3
72
72
11
333
37
21
16
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14225495--14225741
122
2.0
124
88
3
374
38
22
13
24
1.91
14225620--14225795
71
2.5
70
87
5
232
33
23
14
28
1.94
14234103--14234138
12
3.0
12
87
0
54
38
5
27
27
1.79
14236110--14236146
2
18.5
2
94
0
65
48
0
2
48
1.15
14236722--14236754
14
2.4
14
94
0
57
6
0
33
60
1.21
14236677--14236741
28
2.4
27
73
2
67
6
3
16
73
1.16
14236750--14236782
14
2.4
14
94
0
57
0
6
3
90
0.52
14236750--14236782
16
2.2
15
89
10
50
0
6
3
90
0.52
14238854--14238908
23
2.3
23
84
3
65
41
3
1
52
1.29
14243389--14243433
17
2.6
18
76
16
51
66
0
0
33
0.92
14243360--14243514
53
3.0
52
79
15
153
60
3
1
34
1.24
14243506--14243547
19
2.3
19
83
4
50
57
0
0
42
0.99
14244669--14244748
30
2.7
30
88
3
108
36
31
22
10
1.87
14247250--14247306
30
1.9
29
85
3
78
33
10
26
29
1.90
14247646--14248008
47
7.8
45
73
9
255
28
19
28
22
1.98
14247644--14248010
94
3.9
91
77
10
350
28
19
28
22
1.98
14247646--14248009
141
2.6
140
76
12
327
28
19
28
22
1.98
14254399--14254463
30
2.2
30
86
5
87
36
30
21
10
1.88
14256812--14256948
67
2.0
67
97
0
256
33
31
10
24
1.89
14259457--14259484
1
28.0
1
100
0
56
100
0
0
0
0.00
14261648--14261679
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
14261648--14261678
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14266100--14266131
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
14266100--14266130
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
14270654--14270765
36
3.1
36
65
10
86
26
24
23
25
2.00
14271713--14271786
37
2.0
37
91
0
121
9
21
14
54
1.69
14273698--14273733
15
2.4
15
95
0
63
44
5
13
36
1.68
14274323--14274347
13
1.9
13
100
0
50
36
0
16
48
1.46
14274420--14274497
30
2.6
30
85
2
104
12
32
1
53
1.47
14274885--14274949
31
2.1
32
97
2
123
21
15
10
52
1.73
14278245--14278282
18
2.1
18
90
9
60
26
18
0
55
1.43
14278631--14278668
19
2.0
19
94
0
67
28
5
28
36
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433