Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  384  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119902752--119902784
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17
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5
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0
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1.46
119909075--119909108
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18
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2
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1.30
119909828--119909887
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17
2.0
17
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0
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0
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0
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2
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23
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5.2
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0
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20
25
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20
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14
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0
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4
0
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1.26
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22
1.9
22
85
9
59
52
7
7
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1.56
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4.7
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0
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30
5
0
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0
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100
0
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0
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3
0
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1.17
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18
2.4
17
81
11
50
51
18
2
27
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119972282--119972356
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2.0
37
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0
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119974518--119974562
2
23.5
2
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8
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46
0
0
53
1.00
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2.0
33
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0
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26
23
37
1.90
119977314--119977341
2
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2
100
0
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50
0
0
50
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2.0
21
100
0
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23
14
14
1.80
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2.0
73
94
0
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18
4
35
1.70
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2
42
1.60
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2.5
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2
150
25
20
14
39
1.90
119991852--119991883
14
2.4
14
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10
50
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1.83
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0
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28
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4.3
48
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5
218
27
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26
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1.94
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0
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1.89
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42
2.5
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142
30
14
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21
2.0
21
100
0
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14
14
1.80
120013595--120013739
73
2.0
73
94
0
254
42
18
4
35
1.70
120013786--120013856
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5.4
13
76
15
65
40
14
2
42
1.60
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2.5
44
80
2
150
25
20
14
39
1.90
120015863--120015894
14
2.4
14
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10
50
37
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18
34
1.83
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2
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0
66
48
0
0
51
1.00
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50
2.2
51
94
3
202
36
15
22
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120022885--120023002
31
3.8
31
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0
182
26
17
28
27
1.98
120023024--120023227
49
4.3
48
85
5
218
27
13
26
31
1.94
120025898--120026165
46
5.8
46
90
0
385
41
14
23
21
1.89
120026969--120027072
42
2.5
43
85
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142
30
14
25
28
1.95
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29
2.3
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55
5
11
26
1.58
120033180--120033317
27
5.1
28
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171
35
22
23
18
1.95
120033734--120033763
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1.9
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3
20
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1.60
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5.2
26
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211
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24
5
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1.78
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20
1.97
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2.1
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27
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4.2
25
72
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31
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0
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51
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120048422--120048478
28
2.1
28
84
9
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8
5
33
1.55
120049212--120049286
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38
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1
0
52
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2.1
22
83
0
56
65
4
0
30
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
50
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14
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20
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2
1
70
1.10
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2
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120072909--120072952
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120102888--120102965
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3.4
23
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18
63
66
1
1
30
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120102891--120103055
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3.9
43
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2
2
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1.48
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0
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4
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1.30
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2.5
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3.0
46
85
8
130
34
14
23
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120152780--120152999
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4.7
49
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29
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1.95
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2.6
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1.77
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1.23
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2.9
32
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0
159
50
17
4
27
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433