Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  21  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5635726--5635901
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46
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29
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20
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30
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0
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10
60
68
0
2
29
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2.9
21
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38
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1.22
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2.9
21
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0
3
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1.16
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5.0
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25
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4.0
46
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1
0
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16
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0
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5.1
30
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0
2
34
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13
71
24
83
64
0
2
32
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5672055--5672189
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4.2
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0
2
32
1.14
5672035--5672189
10
13.8
12
70
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97
63
0
2
33
1.13
5672040--5672192
30
5.2
29
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13
149
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0
2
34
1.14
5672095--5672179
3
28.0
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75
19
79
64
0
2
32
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52
1
0
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20
18
1.96
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19
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0
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19
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19
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2
2
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1.9
18
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0
52
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0
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74
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2.7
43
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10
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2
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28
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22
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0
56
0
16
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90
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12
28
29
1.94
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42
2.0
42
97
0
159
28
15
27
28
1.96
5709198--5709725
132
4.0
132
71
14
442
29
14
27
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
27
26
1.96
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2.0
216
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661
29
14
27
28
1.95
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3.0
175
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796
30
15
27
26
1.96
5709111--5709844
45
16.5
44
67
17
308
30
14
27
27
1.95
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2.2
20
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0
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0
64
1.07
5711508--5711560
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4.8
12
73
17
60
32
1
0
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1.03
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13
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7
0
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1.23
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13
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20
2
2
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21
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2
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1.12
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1.9
18
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0
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20
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19
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2.1
23
81
14
55
56
14
0
29
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5719944--5720007
13
4.9
13
79
7
67
31
4
26
37
1.77
5719944--5720007
26
2.5
26
82
5
76
31
4
26
37
1.77
5724382--5724467
45
1.9
45
97
0
163
26
27
22
23
1.99
5731312--5731370
27
2.2
27
100
0
118
32
15
3
49
1.61
5733459--5733501
22
2.0
22
86
9
61
60
11
6
20
1.54
5734187--5734226
9
4.2
10
76
23
50
27
2
0
70
1.01
5741117--5741160
18
2.4
18
88
0
61
13
13
20
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1.74
5747405--5747432
13
2.2
13
100
0
56
35
7
25
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5748821--5748874
20
2.7
20
82
0
54
55
3
7
33
1.45
5750270--5750350
40
2.0
40
95
0
144
39
7
17
35
1.78
5751738--5751778
2
21.0
2
90
5
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48
0
2
48
1.14
5752913--5752948
2
18.5
2
94
5
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50
0
0
50
1.00
5765188--5765219
3
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3
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0
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31
0
34
1.58
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2.0
32
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4
9
30
1.52
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37
2.6
37
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1
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40
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11
17
1.86
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2.4
27
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0
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19
1.87
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2.2
33
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0
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2.0
16
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0
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26
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0
150
33
5
25
35
1.80
5782112--5782176
26
2.4
28
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5
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30
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13
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1.93
5782279--5782394
27
4.3
27
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1
178
19
24
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33
1.97
5782279--5782416
54
2.5
55
88
2
190
20
23
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5782279--5782418
27
5.2
28
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7
166
20
23
21
35
1.96
5783949--5783998
10
5.0
10
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9
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70
2
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22
1.20
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3.1
15
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13
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0
2
20
0.88
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10
5.0
10
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9
66
70
2
6
22
1.20
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2.0
23
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0
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0
0
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20
1.96
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25
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19
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20
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3.0
209
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2.0
65
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0
235
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1.61
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27
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0
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0
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0
0
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0
0
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2.0
31
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9
100
0
56
0
21
0
78
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5878265--5878305
21
2.0
21
90
0
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39
19
21
19
1.93
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12.3
3
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5
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68
0
31
0
0.90
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12
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0
30
0
0.89
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2.0
47
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0
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1.82
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0
0
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0
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0
0
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2.2
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0
0
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3.5
39
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118
33
24
16
26
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433