Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  371  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116337171--116337355
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116337111--116337324
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1.9
114
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1
13
47
1.51
116337171--116337355
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2.1
87
84
7
234
38
2
11
47
1.53
116337429--116337484
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25
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142
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2.0
136
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24
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0
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2.4
19
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13
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116366995--116367031
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1.9
19
100
0
74
37
10
16
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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0
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6
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4.9
19
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8
134
36
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10
38
1.81
116368987--116369075
35
2.4
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85
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11
38
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2.3
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0
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20
15
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100
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16
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18
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15
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116373250--116373309
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55
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15
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0
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6
43
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50
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132
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0
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2
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2.4
21
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58
2
4
36
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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63
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5.9
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10
89
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11
14
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1.83
116399322--116399429
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163
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14
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12
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0.79
116421688--116421725
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2.4
16
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0
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23
15
1.95
116421633--116421712
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41
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0
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20
18
1.95
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2.7
44
93
0
202
27
14
26
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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30
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1.93
116462579--116462664
28
3.0
28
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97
25
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29
1.93
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0
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0
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2.0
18
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2
14
58
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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0
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121
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371
39
16
16
26
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.84
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0
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2.9
37
95
0
191
26
31
19
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433