Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  28  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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132
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2.1
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1.00
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2.6
18
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2.0
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180
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1
10
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1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
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2.8
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19
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153
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3.2
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2.1
124
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15
17
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1.91
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2.2
34
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2
123
42
30
1
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1.63
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2.0
46
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2.0
94
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2
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38
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18
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2.3
26
88
0
95
40
22
19
16
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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3.0
30
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16
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15
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92
58
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17
10
1.62
7346329--7346406
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5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
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1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
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12
225
28
28
21
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20
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1.98
7370901--7371070
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2.2
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20
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23
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1
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0.94
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149
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22
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1.92
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24
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8
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36
4
19
40
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7409766--7409838
20
3.8
19
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67
4
4
24
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10
3.6
10
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11
54
70
0
8
20
1.13
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9
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10
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10
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4
4
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1.35
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10
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11
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15
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30
5
5
60
1.40
7410720--7410765
21
2.4
18
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13
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30
4
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1.35
7410743--7410816
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28
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0
5
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2.0
18
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0
2
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0
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1
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1.10
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21
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1.97
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1.9
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4
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0
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0
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0
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0
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18
5
24
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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205
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409
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22
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29
1.97
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100
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0
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1
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0
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1
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0
0
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1.41
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31
2.7
30
83
9
94
61
2
5
31
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7490967--7491017
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10
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1
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5
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0
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29
1
2
66
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433