Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  423  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
0
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0
0
50
1.00
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94
0
65
48
0
2
48
1.15
129778750--129778791
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4.2
10
93
0
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45
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1.36
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2.0
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21
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2.5
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1.34
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2.4
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25
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35
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2.3
23
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23
11
21
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19
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5
5
41
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79
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2
517
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18
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2.0
237
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42
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17
1.9
17
93
0
57
45
3
30
21
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
40
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2
18.5
2
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0
56
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18
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5
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143
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2.2
20
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22
22
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42
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16
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1.95
129865794--129865921
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2.4
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7
143
25
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2.1
27
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5.9
189
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1552
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10
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1.73
129876631--129877779
573
2.0
565
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1699
48
12
9
28
1.73
129878321--129878415
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2.6
37
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3
48
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2.0
30
96
0
113
55
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9
21
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
129890004--129890030
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2.1
13
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7
62
1.46
129893127--129893307
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1.8
101
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24
7
24
1.80
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184
1.8
183
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511
42
24
8
24
1.82
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5.7
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10
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1.84
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2.3
23
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12
27
1.93
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137
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25
14
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1.95
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14
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1.95
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20
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1.99
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1.95
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1.94
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2.3
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18
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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2
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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25
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15
26
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433