Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  26  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6759317--6759888
220
2.6
220
88
3
864
33
18
20
26
1.96
6759831--6760047
78
2.8
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0
362
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20
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24
1.98
6760061--6760206
44
3.3
44
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6
143
36
17
22
22
1.94
6760387--6760603
78
2.8
78
87
0
317
31
18
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1.97
6759568--6760698
556
2.0
556
94
1
1980
32
18
22
26
1.97
6760544--6760816
45
6.0
45
78
8
277
31
15
27
25
1.96
6760617--6760816
89
2.2
90
85
3
278
33
15
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1.95
6760543--6760799
134
1.9
136
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30
15
27
26
1.96
6761151--6761241
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4.9
19
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143
38
10
15
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1.83
6761151--6761264
19
5.8
22
76
17
78
37
9
15
36
1.81
6761531--6761564
17
2.0
17
88
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32
0
0
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2.2
127
92
0
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6763908--6763958
25
2.0
25
100
0
102
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11
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1.90
6775714--6775831
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2.6
45
77
9
116
26
21
25
27
1.99
6775819--6775913
46
2.0
46
86
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129
34
17
21
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1.95
6775802--6775921
47
2.6
47
82
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138
32
18
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1.97
6778613--6778915
127
2.4
127
88
2
473
26
16
18
38
1.92
6779247--6779376
43
3.0
43
93
2
206
26
18
29
26
1.98
6785392--6785517
9
13.6
9
78
9
128
32
0
20
46
1.57
6785396--6785517
38
3.3
38
79
17
139
31
0
20
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1.56
6785637--6786793
241
4.8
241
98
0
2224
32
15
17
33
1.92
6787345--6787381
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6789458--6789487
14
2.1
15
93
6
53
36
0
13
50
1.42
6790776--6790825
22
2.3
22
86
3
66
44
0
2
54
1.11
6790776--6790823
7
6.9
7
81
6
53
43
0
2
54
1.12
6791815--6792068
41
6.5
40
72
13
170
26
17
22
32
1.97
6791823--6792030
41
5.3
41
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12
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27
16
22
32
1.96
6791846--6791983
72
1.9
71
86
4
197
27
15
24
32
1.95
6792096--6792124
12
2.5
12
94
5
51
48
27
13
10
1.75
6803301--6803628
128
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392
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20
17
26
1.94
6804675--6804708
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12
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4
50
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2
0
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1.13
6808940--6809047
26
4.2
26
92
0
189
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25
5
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46
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0
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1.90
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20
2.1
20
90
0
66
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4
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19
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9
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34
2
0
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2.0
148
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571
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10
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0
0
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2.0
30
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1
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3.2
25
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81
38
0
19
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2.0
42
100
0
166
38
0
19
42
1.51
6859470--6859517
23
2.1
23
84
0
60
45
25
12
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1.82
6861178--6861223
23
2.0
24
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76
45
0
21
32
1.52
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13
2.5
13
95
5
57
56
6
18
18
1.62
6863425--6863474
25
2.0
25
100
0
100
24
16
4
56
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6870768--6870803
18
2.0
18
88
0
54
55
0
2
41
1.14
6871181--6871206
13
2.0
13
100
0
52
15
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15
1.83
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16
2.1
16
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11
50
6
3
33
57
1.38
6874535--6874785
132
1.9
132
85
4
346
33
20
19
27
1.96
6875122--6875151
14
2.1
14
93
0
51
56
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16
20
1.62
6875484--6875517
2
17.0
2
93
0
59
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0
2
50
1.16
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29
17
20
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2.1
15
93
0
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0
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0
0
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2.7
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9
51
38
2
0
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6903724--6903830
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2.3
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10
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19
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145
21
26
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1.98
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6.0
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92
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424
22
23
14
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1.91
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4.2
11
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10
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62
2
0
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1.07
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1
424
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24
28
24
1.99
6916465--6916737
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117
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424
22
24
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1.99
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27
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17
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0
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0
122
36
19
13
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6929944--6930061
62
1.9
59
83
8
148
41
2
3
52
1.31
6930170--6930218
25
1.9
26
91
4
82
40
6
14
38
1.71
6935269--6935312
24
2.0
24
86
13
67
31
9
4
54
1.52
6935270--6935321
23
2.3
23
81
12
56
34
7
3
53
1.48
6936784--6936825
22
2.0
22
86
9
61
40
4
0
54
1.21
6939427--6939465
18
2.1
18
85
4
51
43
0
10
46
1.37
6941725--6941751
11
2.5
11
100
0
54
37
0
0
62
0.95
6943948--6943989
22
1.9
22
90
0
66
42
14
4
38
1.66
6952692--6952739
20
2.4
20
80
10
53
39
6
6
47
1.54
6953313--6953376
24
2.7
23
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15
67
60
6
0
32
1.21
6953362--6953386
12
2.1
12
100
0
50
68
8
0
24
1.16
6953936--6953987
11
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11
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15
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19
1
1
76
0.97
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26
13.9
26
76
10
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29
4
5
60
1.38
6954786--6955149
53
6.9
52
76
10
305
29
4
5
60
1.38
6954813--6955097
108
2.7
103
77
11
251
29
3
5
61
1.36
6957054--6957107
27
2.0
27
96
0
99
33
5
25
35
1.80
6960679--6960716
18
2.1
18
90
0
58
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18
13
21
1.82
6960927--6960964
18
2.1
18
95
0
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42
47
2
7
1.46
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13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
6960963--6961023
20
3.1
19
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15
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73
4
1
19
1.10
6961040--6961125
9
9.6
9
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5
111
25
10
20
43
1.84
6963208--6963298
30
3.0
30
83
3
103
45
0
6
48
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6963196--6963271
30
2.8
25
71
22
64
42
0
7
50
1.31
6965294--6965331
19
2.0
19
85
10
51
18
10
0
71
1.14
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16
1.9
16
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0
53
41
0
3
54
1.16
6971705--6971769
29
2.2
29
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5
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36
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9
47
1.60
6972099--6972131
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1.9
17
100
0
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1.68
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122
1.8
122
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4
264
26
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17
40
1.88
6981820--6981853
16
2.0
18
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0
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5
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1.26
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2.5
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14
75
30
6
14
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1.70
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20
2.2
20
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0
24
1.26
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2
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2
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0
0
50
1.00
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2
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1.20
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4
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1.93
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17
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17
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0
5
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1.15
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1.99
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26
26
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26
1.99
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19
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1.93
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0
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0
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23
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2.9
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0
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2.0
19
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20
1.75
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253
1.8
251
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1
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38
19
12
28
1.89
7022916--7022945
12
2.4
13
88
11
53
0
13
6
80
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7028361--7028401
15
2.7
15
76
23
50
34
0
2
63
1.08
7029222--7029264
17
2.4
19
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14
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69
0
2
27
1.00
7029318--7029392
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2.5
29
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1
0
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1.09
7029315--7029371
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0
0
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3
3
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1.35
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10
1
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1.28
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53
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1.96
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19
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3
0
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24
2.6
22
80
10
75
43
21
18
16
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433