Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  276  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85739926--85740056
6
21.3
6
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19
19
1.80
85739952--85740022
19
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10
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45
12
22
19
1.84
85739935--85740034
37
2.7
37
87
0
137
48
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21
20
1.80
85739935--85740056
37
3.5
37
77
15
132
48
11
20
19
1.80
85739947--85740062
31
3.5
31
75
15
108
47
11
20
20
1.80
85740559--85740806
27
9.2
27
86
0
307
37
6
24
31
1.82
85740559--85740806
54
4.6
54
89
0
343
37
6
24
31
1.82
85743581--85743711
30
4.5
30
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10
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32
14
25
28
1.95
85743581--85743711
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59
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160
32
14
25
28
1.95
85746112--85746304
27
7.2
26
91
1
251
41
20
19
19
1.91
85746119--85746304
80
2.3
80
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259
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19
18
19
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16
1.9
16
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0
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48
9
0
41
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40
4.7
40
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26
25
20
26
1.99
85758173--85758206
14
2.3
15
90
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52
38
14
2
44
1.61
85759627--85759675
25
1.9
26
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4
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32
16
10
40
1.82
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25
1.9
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33
18
14
33
1.91
85764277--85764330
11
5.4
10
78
12
58
35
11
18
35
1.86
85764377--85764445
26
2.7
26
82
10
81
30
26
20
23
1.98
85764377--85764454
25
3.1
25
82
10
88
33
23
17
25
1.96
85764667--85764750
31
2.7
31
92
1
143
32
19
25
23
1.97
85768137--85768342
40
5.2
40
91
0
322
22
19
30
27
1.98
85773954--85774066
57
2.0
57
83
0
145
29
15
21
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85774134--85774174
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
85778666--85778720
18
3.1
18
89
0
83
47
14
20
18
1.83
85779051--85779150
27
3.7
27
81
2
112
43
15
15
27
1.85
85779067--85779160
27
3.5
26
76
11
91
41
12
14
30
1.84
85779374--85779407
17
1.9
18
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5
52
11
32
41
14
1.82
85783762--85783871
27
4.1
27
83
3
125
44
20
14
20
1.86
85784277--85784375
40
2.5
41
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5
103
32
18
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28
1.96
85787484--85787619
24
5.7
24
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150
23
13
28
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1.92
85787484--85787620
72
1.9
72
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0
193
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13
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1.92
85790289--85790377
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130
21
17
25
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1.96
85799676--85799786
57
1.9
57
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143
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1.95
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61
2.3
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2
182
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14
21
31
1.93
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40
4.3
40
83
5
220
26
27
21
24
2.00
85809121--85809277
40
3.9
40
84
3
217
27
28
21
23
1.99
85812290--85812446
40
3.9
40
83
5
210
28
27
21
23
1.99
85812784--85812821
20
1.9
20
88
0
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2
10
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20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
85831168--85831200
17
1.9
17
93
0
57
9
21
0
69
1.15
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89
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54
21
21
2
1.58
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28
3.9
28
82
1
130
22
23
17
35
1.95
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4.6
39
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23
27
22
2.00
85840209--85840397
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85847293--85847476
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
85847333--85847521
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
85854523--85854706
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
85854563--85854751
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
85857554--85857726
46
3.7
46
79
13
210
21
20
28
29
1.98
85857551--85857721
93
1.8
93
94
0
306
21
21
29
28
1.98
85865120--85865290
43
3.7
47
76
16
164
21
19
29
29
1.98
85865517--85865554
19
2.0
20
85
15
53
39
0
21
39
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22
2.0
23
84
8
60
59
6
12
21
1.55
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2.2
55
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0
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24
30
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1.96
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1.9
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0
127
13
25
34
26
1.93
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1.9
80
81
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183
22
30
24
22
1.99
85878434--85878541
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
85884272--85884311
21
2.0
20
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19
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0
0
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5
5
30
1.43
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49
2.5
47
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6
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9
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32
17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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28
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54
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40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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29
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433