Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  376  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117680647--117680766
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2
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1.30
117683905--117683973
27
2.5
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9
90
34
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1
57
1.31
117683931--117683980
18
2.8
18
77
19
59
36
4
0
60
1.16
117683931--117683989
9
6.6
9
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3
1
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1.24
117684036--117684065
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1.9
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0
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117685225--117685265
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19
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24
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26
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22
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27
27
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14
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20
22
29
1.99
117729668--117729815
40
3.7
39
77
13
140
28
18
21
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
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28
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21
1.98
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3.7
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10
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20
21
1.98
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2.0
30
90
0
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30
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117732995--117733042
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2.2
22
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2.0
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1.52
117733068--117733110
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2.0
22
90
0
68
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0
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1.61
117733165--117733294
15
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77
19
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1.62
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48
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1.59
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2.2
24
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4.3
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26
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21
30
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26
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21
30
1.98
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90
10
84
35
19
8
36
1.83
117738763--117738811
5
10.2
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36
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35
18
9
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1.83
117740583--117740684
9
11.1
9
76
12
91
45
19
1
33
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117745786--117745814
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2.1
14
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34
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117746423--117746516
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47
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32
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117756955--117757113
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18
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1.98
117757007--117757113
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29
27
18
24
1.98
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22
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12
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0
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24
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433