Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  359  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112814203--112814274
11
7.1
11
70
17
66
36
12
19
31
1.89
112814192--112814274
20
4.2
20
96
0
157
36
12
19
32
1.88
112814328--112814446
24
5.0
23
90
7
159
29
21
21
27
1.98
112814328--112814426
24
4.1
25
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5
170
31
20
20
28
1.97
112819808--112819834
13
2.1
13
100
0
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22
7
22
48
1.75
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0
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0
0
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100
0
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0
0
65
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0
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0
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0
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1.00
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5
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0
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19
0
0
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39
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1
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29
25
21
1.99
112833502--112833694
77
2.5
77
93
1
314
23
29
25
21
1.99
112840392--112840459
17
4.1
17
75
16
61
29
2
1
66
1.15
112840393--112840444
20
2.7
20
87
3
79
30
0
1
67
1.02
112840416--112840459
13
3.0
14
84
15
54
29
4
0
65
1.12
112841769--112842019
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5.0
51
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2
222
30
24
19
25
1.98
112843566--112843618
17
3.3
17
80
17
60
33
5
0
60
1.20
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10
13.6
10
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20
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35
3
1
59
1.24
112843641--112843727
2
45.5
2
74
13
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40
1
2
56
1.19
112843651--112843733
29
3.0
28
75
20
86
37
1
2
59
1.19
112843641--112843728
31
2.9
29
77
9
86
39
1
2
56
1.19
112855759--112856542
78
10.1
78
91
0
1203
32
18
23
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112858111--112858158
20
2.3
20
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3
60
31
2
2
64
1.16
112858232--112858284
17
3.3
17
80
17
60
33
5
0
60
1.20
112858308--112858370
23
2.7
23
83
13
76
38
1
1
58
1.17
112858311--112858380
31
2.3
31
85
5
88
37
1
1
60
1.15
112858311--112858380
23
3.0
22
80
17
72
37
1
1
60
1.15
112858334--112858417
31
2.6
33
81
9
84
35
2
3
58
1.28
112860863--112860914
23
2.3
23
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0
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26
25
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32
1.95
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24
2.5
22
81
10
78
29
22
14
33
1.93
112860952--112861000
24
2.0
24
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0
80
30
22
12
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1.91
112871424--112871470
24
2.0
24
95
0
85
25
23
14
36
1.93
112878316--112878480
42
4.0
42
86
3
201
21
19
24
33
1.97
112878316--112878480
83
2.0
83
84
4
217
21
19
24
33
1.97
112878323--112878500
42
4.3
42
85
5
186
20
19
24
34
1.96
112895050--112895124
37
2.0
37
100
0
150
52
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10
29
1.65
112904752--112904801
25
2.0
25
81
11
59
68
8
8
16
1.38
112914575--112914607
10
3.4
10
95
4
59
60
0
6
33
1.21
112914602--112914659
27
2.1
27
87
6
82
48
12
0
39
1.40
112915727--112915791
25
2.6
24
73
4
58
21
26
12
40
1.88
112915707--112915833
50
2.5
50
73
7
123
21
22
16
39
1.92
112916020--112916058
19
2.2
19
86
9
55
46
5
12
35
1.65
112916788--112916842
26
2.1
26
100
0
110
30
7
23
38
1.82
112918214--112918292
36
2.1
38
90
9
126
36
10
17
35
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112918214--112918292
19
4.2
19
90
9
126
36
10
17
35
1.84
112928640--112928727
40
2.2
40
81
0
113
35
18
17
29
1.93
112932234--112932273
19
2.1
19
100
0
80
50
25
0
25
1.50
112937469--112937741
48
5.7
48
74
12
224
26
31
17
25
1.97
112937664--112937882
46
4.7
46
77
10
162
25
29
18
26
1.98
112937472--112937843
46
7.9
47
73
14
241
25
31
17
26
1.97
112937471--112937880
47
8.7
47
73
14
235
25
30
17
26
1.97
112939629--112939954
43
7.6
43
86
2
431
23
18
28
29
1.98
112944255--112944305
25
2.1
24
86
13
70
43
9
0
47
1.36
112962476--112962541
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2.8
24
82
13
75
60
4
7
27
1.43
112962649--112962691
22
2.0
20
86
8
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62
0
2
34
1.08
112962704--112962745
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2.2
19
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4
57
59
2
7
30
1.37
112964116--112964149
14
2.4
15
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14
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11
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0
0
50
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53
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0
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0
0
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0
0
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29
12
12
46
1.77
112977829--112977864
17
2.1
17
94
0
63
25
11
16
47
1.79
112981467--112981516
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2.2
23
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10
59
58
8
10
24
1.57
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25
4.2
26
91
3
180
33
7
23
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112983870--112983975
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2.1
51
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33
7
23
35
1.83
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25
2.0
25
85
7
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19
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25
1.91
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4.2
26
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1
180
32
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36
1.81
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2.1
22
100
0
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1.91
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24
2.0
25
85
7
68
25
13
23
37
1.92
112994603--112994685
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3.2
26
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1
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1.77
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2.9
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0
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37
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1.83
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19
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0
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0
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1.19
113015211--113015293
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19
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1.27
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1.13
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2.7
206
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51
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2
32
1.18
113029662--113029792
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2.4
55
78
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128
60
1
3
34
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
1
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64
0
1
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1
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1.24
113029650--113029891
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25
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1
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1.24
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23
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27
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0
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1.98
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9
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0
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0
0
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0
0
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0.95
113056164--113056206
19
2.2
20
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0
0
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0.95
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0
0
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0
50
0
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2.2
35
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4
84
29
7
18
44
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113071104--113071156
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2.1
26
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45
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26
1.82
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3.1
30
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1.71
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4
0
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1.18
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9.4
13
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16
112
39
0
2
57
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433