Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  378  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118137636--118137786
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3.8
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24
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21
2.00
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23
28
23
2.00
118137635--118137802
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2.1
80
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207
26
23
27
22
2.00
118145656--118145783
40
3.2
40
82
2
141
26
22
27
23
2.00
118153799--118153825
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1.9
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100
0
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22
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3.5
20
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2.3
26
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19
16
19
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118158023--118158083
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0
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152
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0
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1.48
118160495--118160601
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0
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4.2
125
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38
15
15
30
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18
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18
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21
21
1.79
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0
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0
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0.53
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100
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0
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0
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18
2.5
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20
62
60
6
4
28
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20
2.0
19
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41
5
0
53
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2.3
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70
46
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11
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1.40
118196215--118196313
31
3.3
31
83
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105
50
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12
29
1.68
118196953--118197000
2
23.5
2
78
4
51
50
8
0
41
1.33
118202295--118202392
42
2.3
43
79
8
103
36
6
3
54
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118214919--118214944
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4.3
6
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0
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0
0
15
0.62
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3
33.3
3
69
22
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30
8
2
60
1.37
118221427--118221497
14
4.7
15
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14
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32
7
0
60
1.23
118221431--118221497
28
2.4
28
82
7
73
32
7
0
59
1.25
118221462--118221516
23
2.4
23
81
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67
32
9
0
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1.30
118221566--118221658
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4.6
20
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20
68
26
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1
63
1.30
118221427--118221640
3
71.7
3
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11
73
29
8
0
60
1.33
118233559--118233791
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5.3
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23
22
1.98
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2.9
88
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0
432
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20
23
23
1.98
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3.3
44
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11
114
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26
21
23
1.99
118233853--118234105
88
2.9
88
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0
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23
21
27
1.99
118234503--118234563
22
2.7
23
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12
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4
9
1.58
118234983--118235013
6
5.2
6
96
0
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3
0
12
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2.3
13
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10
20
51
17
1.74
118235790--118236068
3
94.3
3
68
13
98
28
8
1
61
1.34
118235838--118235899
14
4.6
14
75
11
51
32
8
0
59
1.26
118235866--118235921
23
2.4
24
82
8
71
32
8
0
58
1.29
118235959--118236013
16
3.8
15
79
16
62
25
7
0
67
1.16
118235977--118236053
22
3.5
22
80
8
86
25
7
1
64
1.28
118235871--118236086
75
2.9
76
73
16
182
27
9
0
61
1.33
118236038--118236092
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2.3
23
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25
5
0
69
1.10
118237288--118237338
16
3.3
15
73
15
50
58
1
0
39
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118237299--118237337
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15
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56
0
0
43
0.99
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21
2.6
21
76
2
56
62
7
0
29
1.22
118243318--118243416
46
2.1
47
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10
134
22
30
18
29
1.97
118250175--118250400
95
2.4
95
77
10
241
22
31
19
26
1.98
118250372--118250495
46
2.6
48
81
5
128
24
29
16
30
1.96
118250826--118250906
30
2.7
30
94
0
135
37
29
4
28
1.78
118254270--118254294
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1.9
13
100
0
50
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32
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1.86
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18
2.0
18
100
0
72
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11
38
1.88
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152
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23
29
1.97
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1.9
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186
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16
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17
2.2
17
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0
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1.55
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1.9
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22
19
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1.97
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2.7
43
82
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126
21
19
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29
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0
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23
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
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1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433