Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  409  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126194801--126194851
25
2.0
25
96
0
93
37
11
13
37
1.82
126202142--126202519
84
4.5
84
90
3
562
32
22
22
22
1.98
126202142--126202538
170
2.3
167
90
3
589
32
21
22
23
1.98
126202523--126202702
92
2.0
91
88
3
272
31
17
23
26
1.97
126202648--126202758
44
2.5
44
83
0
150
30
14
27
27
1.95
126202780--126203016
87
2.7
87
86
1
251
29
19
23
27
1.98
126202828--126203016
87
2.2
87
95
0
333
28
19
24
27
1.98
126203455--126203535
19
3.9
19
80
17
90
37
11
17
34
1.85
126203464--126203514
25
2.0
25
96
0
93
37
11
13
37
1.82
126205915--126205966
24
2.2
24
89
0
77
38
3
9
48
1.54
126206116--126206141
12
2.2
12
100
0
52
15
0
0
84
0.62
126210293--126210344
24
2.2
24
89
0
77
36
3
9
50
1.54
126210495--126210519
11
2.3
11
100
0
50
16
0
0
84
0.63
126213769--126213819
14
3.6
14
75
15
59
56
0
5
37
1.23
126213769--126213835
30
2.3
29
84
7
82
58
1
4
35
1.28
126215025--126215059
19
1.9
17
88
11
52
80
2
11
5
1.00
126215728--126216294
45
12.7
44
69
10
177
27
22
19
31
1.97
126215729--126216294
44
12.7
42
69
14
212
27
22
19
30
1.98
126215827--126216334
89
5.7
89
72
10
336
27
21
19
31
1.97
126215866--126216336
179
2.6
178
89
0
708
28
22
18
31
1.97
126216660--126216860
44
4.6
44
69
9
133
22
23
19
33
1.97
126216701--126216859
43
3.7
43
73
6
142
25
21
19
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126216377--126216858
87
5.5
88
84
3
582
21
22
20
35
1.96
126224419--126224464
21
2.1
22
84
11
60
65
0
6
28
1.17
126224439--126224563
17
7.1
17
71
21
64
64
2
3
29
1.21
126224499--126224598
15
5.9
17
68
17
57
65
0
4
31
1.11
126224469--126224569
45
2.2
45
81
13
111
64
1
2
30
1.19
126224501--126224572
31
2.4
31
77
13
78
68
0
1
30
0.99
126224605--126224658
26
2.1
25
83
16
67
42
3
5
48
1.44
126224604--126224668
26
2.6
25
80
20
66
47
3
6
43
1.43
126224739--126224785
23
2.0
23
83
0
58
61
2
8
27
1.36
126226032--126226165
41
3.1
40
66
22
101
34
25
14
26
1.94
126226011--126226209
88
2.3
88
92
0
326
28
27
16
27
1.97
126226045--126226179
41
3.1
41
64
29
100
34
24
14
26
1.94
126226187--126226831
45
15.1
45
70
17
369
25
24
19
29
1.98
126226167--126226630
127
3.6
126
81
8
526
26
23
19
30
1.98
126226409--126226822
209
2.0
209
93
0
711
26
25
20
28
1.99
126226492--126226691
82
2.4
82
91
0
310
26
26
19
28
1.99
126226574--126226831
127
2.0
127
93
1
437
25
25
19
29
1.98
126233868--126233930
22
2.9
22
86
9
85
66
0
7
25
1.18
126233868--126233936
21
3.2
20
84
13
77
66
1
7
24
1.25
126233919--126234032
16
7.7
15
75
15
80
64
2
2
30
1.21
126233969--126234032
14
4.4
14
83
13
85
67
0
1
31
1.00
126233967--126234032
30
2.3
27
87
10
87
66
0
1
31
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126233920--126234041
44
3.0
42
83
11
123
63
2
2
31
1.21
126233969--126234049
25
3.1
25
75
18
76
65
0
3
30
1.10
126233934--126234041
39
2.7
39
84
13
123
62
1
2
32
1.20
126236073--126236141
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
126237769--126237806
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
126241554--126241600
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
126241571--126241626
17
3.0
18
87
12
78
33
16
10
39
1.83
126242169--126242215
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
126242186--126242264
19
4.2
19
87
9
117
35
17
10
36
1.84
126242708--126243166
177
2.6
175
91
1
738
28
18
20
33
1.96
126243256--126243401
41
3.5
41
73
18
140
22
22
23
31
1.98
126243230--126243444
41
5.2
43
66
22
122
25
20
22
30
1.98
126243168--126243454
84
3.4
83
88
4
420
23
21
23
31
1.98
126244399--126244438
1
40.0
1
84
0
53
0
7
0
92
0.38
126244399--126244438
12
3.6
11
90
9
64
0
7
0
92
0.38
126250036--126250082
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
126250053--126250108
17
3.0
18
87
12
78
33
16
10
39
1.83
126250618--126250676
31
1.9
31
85
0
82
28
10
11
49
1.72
126255275--126255307
17
1.9
17
100
0
66
30
0
24
45
1.53
126258369--126258429
3
20.0
3
80
9
61
62
4
3
29
1.32
126258601--126258733
3
43.7
3
77
10
119
63
2
3
30
1.21
126260709--126261232
130
4.0
129
82
3
469
26
25
20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126261027--126261314
44
6.6
44
77
7
282
26
26
20
27
1.99
126260803--126261232
130
3.3
130
83
1
495
26
24
20
28
1.99
126260943--126261312
174
2.1
174
82
2
456
26
25
20
28
1.99
126260803--126261314
44
11.7
44
70
12
250
25
25
20
28
1.99
126261850--126261898
21
2.3
21
82
3
53
20
12
10
57
1.64
126267641--126267719
40
2.0
40
84
0
104
17
15
30
36
1.91
126269663--126269724
29
2.1
29
82
5
72
25
8
8
58
1.55
126269895--126269951
29
1.9
30
85
3
80
57
3
8
29
1.45
126276646--126276673
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
126277645--126277685
22
2.0
20
85
9
55
34
0
4
60
1.18
126289175--126289290
44
2.6
45
77
8
121
44
16
23
15
1.85
126290134--126290271
73
1.9
72
84
1
186
31
18
22
27
1.97
126290308--126290444
70
2.0
70
88
2
204
29
16
24
30
1.96
126290462--126290661
55
3.8
54
85
9
263
31
15
17
36
1.91
126292871--126292911
22
2.0
20
85
9
55
34
0
4
60
1.18
126292958--126293023
34
1.9
35
84
3
89
28
3
6
62
1.34
126295288--126295367
38
2.1
38
95
2
144
28
32
23
15
1.95
126299501--126299562
31
2.0
31
100
0
124
29
12
9
48
1.73
126299501--126299578
31
2.5
31
91
0
111
26
11
11
50
1.73
126305086--126305169
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
126312095--126312178
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
126318210--126318237
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126321076--126321397
131
2.5
129
83
5
389
28
18
18
34
1.94
126334794--126335541
177
4.2
175
88
3
1040
31
17
24
26
1.97
126335431--126335667
125
1.9
126
88
2
361
28
17
22
30
1.97
126341622--126341678
29
2.0
29
89
0
87
26
12
29
31
1.92
126343432--126343567
26
5.3
26
95
1
222
34
5
23
36
1.77
126345350--126345634
136
2.1
136
97
1
536
24
19
24
31
1.98
126347757--126347785
7
4.1
7
100
0
58
13
13
0
72
1.13
126349271--126349407
26
5.3
26
96
0
231
34
5
24
36
1.77
126351019--126351158
54
2.6
55
87
2
185
19
24
22
34
1.96
126351017--126351158
27
5.3
26
85
5
158
19
23
22
34
1.96
126352121--126352236
18
6.5
18
84
4
146
38
13
12
35
1.82
126352104--126352236
35
3.8
37
82
8
143
38
13
12
36
1.82
126352112--126352236
53
2.3
54
90
2
198
38
12
12
36
1.82
126352712--126352777
17
3.9
17
73
16
66
34
1
0
63
1.04
126352754--126352803
26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
126354521--126354567
25
1.9
24
83
12
60
31
8
2
57
1.41
126356063--126356611
193
3.0
177
78
10
593
31
14
17
35
1.91
126356242--126356702
193
2.4
192
89
1
681
32
14
16
36
1.89
126357837--126357886
20
2.5
20
77
6
57
58
0
2
40
1.10
126358096--126358147
24
2.2
24
86
6
70
34
3
9
51
1.53
126358229--126358256
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
126360534--126360568
3
11.3
3
93
6
61
62
0
0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126360621--126360733
22
5.1
23
66
26
66
60
1
3
34
1.24
126362379--126362646
83
3.2
83
92
1
421
27
19
18
33
1.95
126362570--126363047
119
4.0
119
90
0
715
30
19
16
34
1.94
126374904--126374942
20
2.0
20
84
0
51
58
2
2
35
1.25
126374975--126375045
22
3.2
23
70
22
62
61
1
4
32
1.23
126385098--126385887
241
3.3
241
92
0
1301
36
17
12
34
1.87
126386042--126386087
17
2.6
18
93
6
76
69
23
0
6
1.11
126387049--126387332
136
2.1
135
97
0
541
31
25
18
24
1.97
126387339--126387386
21
2.3
21
85
7
62
33
52
2
12
1.51
126387579--126387631
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433