Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  294  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91650763--91650946
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80
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20
19
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33
1.96
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1.9
21
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25
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2.1
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0
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1.98
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39
2.1
39
92
0
133
27
21
22
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1.99
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1.9
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0
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17
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18
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1.9
21
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0
0
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1
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21
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2
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51
68
0
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1.13
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43
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12
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38
8.8
38
89
2
469
30
23
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91727521--91727854
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4.4
75
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2
474
30
23
22
23
1.99
91727521--91727854
113
2.9
113
88
4
460
30
23
22
23
1.99
91728920--91728945
2
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2
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0
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0
0
50
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20
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1.98
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1.8
93
94
0
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20
21
29
28
1.98
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10
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38
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0
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2.0
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211
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21
29
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1.91
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0
0
50
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0
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0
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1.25
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29
16
23
1.96
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21
27
20
29
1.98
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1.9
92
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248
21
28
21
28
1.98
91791573--91791628
6
9.3
6
98
0
103
32
16
0
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1.44
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25
85
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37
29
1
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1.67
91792443--91792499
28
2.0
28
100
0
114
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2.1
34
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1.77
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2.1
48
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0
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20
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33
1.91
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2.0
20
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62
17
27
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1.89
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93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
91821736--91821911
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3.8
46
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12
216
28
29
21
20
1.98
91827792--91827859
27
2.6
27
88
6
95
26
14
27
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91832405--91832576
93
1.8
93
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0
317
27
29
21
20
1.98
91832398--91832573
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
91839656--91840051
96
4.1
96
79
6
415
26
17
28
27
1.98
91839683--91840058
48
7.8
48
72
5
267
26
17
28
28
1.97
91844965--91845141
28
6.3
27
75
13
144
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20
20
35
1.96
91844965--91845192
113
2.0
113
83
5
282
25
20
20
34
1.96
91844965--91845192
57
4.0
56
80
7
230
25
20
20
34
1.96
91847908--91848210
85
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84
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5
317
23
22
18
35
1.96
91847908--91848211
57
5.4
57
82
1
310
23
22
18
35
1.96
91847908--91848211
28
10.8
28
77
3
288
23
22
18
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1.96
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22
2.3
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0
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32
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2
14
1.53
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16
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0
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2.1
98
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8
257
28
9
16
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1.77
91883662--91883712
3
16.7
3
95
4
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66
1
0
31
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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18
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1
1
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1.84
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19
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19
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30
0
6
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1.21
91886557--91886655
20
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19
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1.30
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47
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1.93
91927401--91927984
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1.93
91927401--91927984
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37
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1.99
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2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.97
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10
208
36
17
24
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.86
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1.99
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1.99
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1.99
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1.97
92054917--92055117
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1.8
110
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4
282
33
18
25
22
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433