Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  251  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78297682--78297854
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3.7
46
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1.8
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1.98
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2.0
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0
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28
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25
1.98
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2.1
50
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201
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20
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28
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0
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29
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1
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55
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0
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1.99
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47
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47
75
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19
28
1.98
78313425--78313784
94
3.8
92
78
9
361
23
29
19
28
1.98
78313425--78313784
141
2.6
139
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388
23
29
19
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1.98
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40
3.0
40
93
0
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1.98
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20
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22
24
1.98
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1.8
88
89
0
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27
1.97
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135
2.2
136
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8
327
21
30
20
26
1.98
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3
96
32
25
20
21
1.97
78339501--78339578
40
2.0
40
81
0
93
37
16
15
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78346455--78346494
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11
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52
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2
20
1.59
78347917--78347952
18
2.0
18
100
0
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27
11
11
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19
24
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41
2.3
41
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22
18
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1.98
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20
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21
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45
9
21
23
1.81
78371319--78371493
46
3.8
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193
22
30
20
27
1.98
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2.00
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23
24
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1.99
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40
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6
138
26
23
27
22
2.00
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80
2.4
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4
186
23
24
29
22
1.99
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14
2.7
15
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14
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54
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1.61
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1.8
93
93
0
297
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28
21
21
1.98
78392470--78392642
46
3.7
46
79
10
208
29
27
20
21
1.98
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2.0
30
90
0
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30
25
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36
1.85
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40
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138
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23
27
22
2.00
78404400--78404548
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1.9
80
81
2
183
22
24
30
22
1.99
78404396--78404567
80
2.1
81
77
5
179
23
24
29
22
1.99
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37
100
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1.97
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29
33
10
26
1.90
78411710--78411808
41
2.4
41
80
11
114
24
24
25
26
2.00
78412292--78412715
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24
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17
24
1.96
78414729--78414806
37
2.1
37
100
0
156
20
32
19
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78414909--78415031
49
2.5
49
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0
219
29
33
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26
1.90
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46
4.7
46
81
9
255
29
28
19
22
1.98
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2.6
13
100
0
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8
20
35
35
1.84
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5.3
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439
32
7
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30
1.86
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2.0
66
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39
1.70
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2.5
28
90
2
104
28
28
14
27
1.95
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4.6
40
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202
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1.99
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24
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21
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1.99
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4.6
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17
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25
1.97
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29
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2
131
25
17
32
24
1.97
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2.5
28
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2
126
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15
30
26
1.96
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26
23
27
1.99
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23
27
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198
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5
147
26
33
19
20
1.97
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25
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0
110
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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25
2.00
78525450--78525632
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2.00
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0
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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23
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12
12
50
25
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433