Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  412  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126889445--126889561
57
2.1
57
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9
141
60
0
3
35
1.13
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12.2
19
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0
4
34
1.24
126889497--126889620
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2.5
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18
127
58
0
4
35
1.25
126889635--126889707
23
3.1
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2
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0
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0
0
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1.00
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10
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23
24
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34
1.96
126895774--126895905
45
3.1
45
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23
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407
23
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1.95
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2.1
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23
21
16
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0
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0
0
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243
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3
30
1.32
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246
2.1
236
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5
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32
1.36
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106
2.2
101
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4
333
58
5
2
33
1.33
126907924--126908339
171
2.4
167
93
2
688
62
4
3
30
1.30
126908096--126908541
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2.2
200
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740
62
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3
30
1.28
126910170--126910321
77
2.0
77
94
0
268
33
22
16
27
1.95
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10
2.5
10
100
0
50
16
20
8
56
1.65
126922350--126922477
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3.0
43
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2
161
30
20
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1.98
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2
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2
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0
51
53
0
0
46
1.00
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3.2
12
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53
58
5
0
35
1.20
126925169--126926044
291
3.1
283
88
8
1260
60
4
3
31
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126925627--126925659
16
2.1
15
94
5
57
63
3
0
33
1.10
126925627--126925659
15
2.1
16
88
5
50
63
3
0
33
1.10
126925633--126925679
24
2.0
24
87
8
69
59
6
0
34
1.23
126925926--126926230
18
16.8
19
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16
110
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2
2
33
1.26
126925967--126926582
3
209.7
3
70
18
272
63
2
2
31
1.22
126926457--126926552
23
4.3
23
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8
94
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3
3
34
1.29
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10
2.8
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10
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0
0
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0.65
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92
0
92
45
3
0
50
1.19
126930364--126930430
26
2.5
27
82
4
82
56
4
0
38
1.19
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2
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0
70
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0
0
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204
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2
52
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17
7
36
1.78
126942063--126942101
21
1.9
21
89
5
62
35
7
17
38
1.79
126942137--126942199
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2.1
29
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11
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60
0
0
39
0.97
126945918--126945952
15
2.3
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85
14
56
0
57
0
42
0.99
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3
23.0
3
92
3
111
33
0
0
66
0.92
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2
19.0
2
84
10
51
47
0
5
47
1.24
126946906--126946943
16
2.4
16
95
0
67
47
0
5
47
1.24
126948287--126948329
22
1.9
23
85
4
61
37
13
4
44
1.65
126950335--126950444
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
126956444--126956502
31
1.9
31
92
0
100
42
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11
38
1.68
126959467--126959561
48
2.0
48
82
12
115
43
1
6
49
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126961615--126961705
44
2.1
44
89
0
137
28
12
7
51
1.66
126962020--126962068
20
2.5
20
83
3
64
28
2
16
53
1.54
126963180--126963213
15
2.3
15
89
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50
61
8
0
29
1.26
126967709--126967818
46
2.4
46
89
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159
17
25
14
42
1.87
126967793--126967849
16
3.4
16
70
25
55
19
24
19
36
1.94
126967744--126967897
79
1.9
80
97
1
292
17
25
16
39
1.91
126967824--126968138
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6.9
46
92
0
434
21
24
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60
2
0
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1.09
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2.1
19
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35
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28
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0
0
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10
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2.2
205
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2.1
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172
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0
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0
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0
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0
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0
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19
50
1.74
126991323--126991355
16
2.1
16
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0
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153
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4
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8
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32
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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29
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433